Bolsa de PD em Genética Molecular de Plantas

Post-doctoral fellowship in Plant Molecular Genetics

Nº: 1549

Área de conhecimento: Genética

Field of knowledge: Genetics

Nº do processo FAPESP: 2016/10498-4

FAPESP process: 2016/10498-4

Título do projeto: Investigação das estratégias de adaptação ao estilo de vida patogênico de fungos do gênero Moniliophthora em diferentes níveis de organização biológica: espécies, biótipos e linhagens geográficas

Project title: Investigation of adaptation strategies to the pathogenic life style of fungi from the Moniliophthora genus at various levels of biological organization: species, biotypes and geographic lineages

Área de atuação: Genética Molecular de Plantas

Working area: Plant Molecular Genetics

Início: 01/07/2017

Start: 2017-07-01

Pesquisador responsável: Antonio Vargas de Oliveira Figueira

Principal investigator: Antonio Vargas de Oliveira Figueira

Unidade/Instituição: Centro de Energia Nuclear na Agricultura / Universidade de São Paulo

Unit/Instituition: Centro de Energia Nuclear na Agricultura / Universidade de São Paulo

Data limite para inscrições: 19/06/2017

Deadline for submissions: 2017-06-19

Publicado em: 04/05/2017

Publishing date: 2017-05-04

Localização: Av. Centenário, 303 - São Dimas, Piracicaba - SP, 13400-970

Locale: Av. Centenário, 303 - São Dimas, Piracicaba - SP, 13400-970

E-mail para inscrições: figueira@cena.usp.br

E-mail for proposal submission: figueira@cena.usp.br

  • Resumo Summary

    O Laboratório de Melhoramento de Plantas do CENA/USP oferece oportunidade de bolsa de Pós-Doutorado associada ao Projeto Temático FAPESP 2016/10498-4, intitulado "Investigação das estratégias de adaptação ao estilo de vida patogênico de fungos do gênero Moniliophthora em diferentes níveis de organização biológica: espécies, biótipos e linhagens geográficas", para atuar na área de análise molecular da resistência do tipo não-hospedeiro (non-host resistance - NHR), do envolvimento de pequenos RNAs na interação patógeno x hospedeiro e de fitohormônios na resposta de defesa empregando a interação tomateiro 'Micro-Tom' (MT) com o basidiomiceto Moniliophthora perniciosa (biótipo-S) como modelo para o patossistema da enfermidade vassoura de bruxa do cacaueiro.

    A análise da interação do fungo patogênico M. perniciosa x MT demonstrou algumas evidências de ser um caso NHR quebrada pelo biótipo-S em tomateiro, mas não pelo biótipo-C. A pequena taxa de penetração de MT pelos basidiósporos com hifas emergentes sugere uma interação pouco desenvolvida entre o biótipo-S e MT. Aspectos moleculares de resistência não hospedeiro da interação dos biótipos-S e -C x MT serão investigados por meio de RNA-seq e análise de expressão de genes candidatos associados à NHR, assim como a caracterização histológica do processo de penetração logo após a inoculação. Relatos recentes em outros patossistemas sugerem que, além de proteínas efetoras, patógenos podem empregar RNAs pequenos (sRNA) para manipulação direta do sistema de defesa vegetal. Com isso, a identificação e expressão de sRNAs serão avaliadas durante a infecção de MT por M. perniciosa. A expressão de sRNAs será avaliada por RNA-seq durante a infecção para investigar se esse mecanismo também é empregado por esse patógeno.

    Perfil do candidato: A vaga requer pesquisador independente, criativo, proativo, com excelente capacidade de planejar e executar experimentos, habilidade de trabalhar em equipe e capacidade escrever artigos científicos. Os candidatos devem possuir experiência prévia demonstrada com diversas técnicas de biologia molecular e análise da expressão gênica, sólidos conhecimentos de bioinformática e estatística, e fluência em inglês. Experiência prévia em patologia de plantas e/ou com fungos será considerada uma vantagem, mas não é um pré-requisito. Os candidatos devem possuir doutorado recente em áreas relacionadas ao tema do projeto.

    Espera-se que o candidato selecionado conduza o projeto específico de forma independente e que possa orientar estudantes de graduação e bolsistas de iniciação científica associados às suas atividades. Também será importante o envolvimento do pós-doutor em projetos de estudantes de pós-graduação envolvidos no Projeto Temático.

    A bolsa de Pós-Doutorado é associada ao Projeto Temático FAPESP 2016/10498-4 e está disponível para início em 01/07/2017. A bolsa terá duração de 24 meses.

    Documentos solicitados para seleção:
    - Currículo vitae;
    - Currículo Lattes atualizado;
    - Carta de apresentação contendo justificativa de enquadramento nos requisitos da vaga e breve relato de sua experiência;
    - Duas cartas de referência.

    As inscrições serão recebidas exclusivamente por e-mail, com documentação anexa em formato pdf, enviadas para Antonio Figueira (figueira@cena.usp.br), com prazo final de 19/06/2017.

    The Plant Breeding Laboratory of CENA/USP opens an opportunity for a post-doctoral fellowship associated with the Thematic Project FAPESP 2016/10498-4 entitled "Investigation of adaptation strategies to the pathogenic life style of fungi from the Moniliophthora genus at various levels of biological organization: species, biotypes and geographic lineages" to work on the molecular analysis of non-host resistance (NHR), the potential involvement of small RNAs in the host x pathogen interaction and hormones in the defense response using the interaction 'Micro-Tom' (MT) tomato x basidiomycete Moniliophthora perniciosa (S-Biotype) as a model of the cacao (Theobroma cacao) witches' broom pathosystem.

    The analysis of the M. perniciosa x MT interaction showed some evidences to be a case of a broken NHR by the S-biotype in tomato, but not by the C-biotype. The limited rate of MT penetration by basidiospores with emerging mycelia suggest a little developed pathogenic interaction between the S-biotype and MT. Molecular features of NHR will be evaluated by RNA-seq and NHR candidate gene expression analysis in the S- and C-biotype x MT interactions, together with hystological observations of early penetration events. Recent reports in other pathosystems suggest that, besides effector proteins, pathogens can employ small RNAs (sRNAs) to directly manipulate the plant defense system, and, therefore, identification and expression analysis of sRNAs will be conducted during MT infection by M. perniciosa. sRNAs expression will be followed by RNA-seq during infection to investigate if this mechanism is also employed by M. perniciosa.

    Candidate profile: The opening requires an independent, creative, pro-active, researcher, with excellent ability to plan and conduct experiments, capacity to work in a team and able to write scientific articles. Candidates must have previous experience with various molecular biology and gene expression analysis approaches, solid bioinformatic and statistical knowledge, and fluency in English. Previous experience in plant pathology and/or fungi will be considered as an advantage, but it is not a requisite. Candidates must have completely their PhD recently in fields related to the project.

    It is expected that the individual will be capable to independently lead the project and to advise undergraduate students in activities associated with his/her activities. It is also expected that the individual collaborates in other graduate students (MSc and PhD) projects associated with the main Thematic Project. The fellowship is associated with the Thematic Project FAPESP 2016/10498-4, and it s planned to start by July 1st, 2017, for 24 months.

    Required documents for selection:
    - Curriculum vitae;
    - Letter of intention with a reasoning of why the candidate is suitable for the position, with a brief description of previous experience;
    - Two reference letters from previous professors/advisors.

    Documents will be accepted exclusively by e-mail, with attached documents as pdf files, sent to Antonio Figueira (figueira@cena.usp.br) up to June 19th, 2017.

    This opportunity is open to candidates of any nationalities. The selected candidate will receive a FAPESP's Post-Doctoral fellowship in the amount of R$ 6.819,30 monthly and a research contingency fund, equivalent to 15% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.

    More information about the fellowship is at: www.fapesp.br/en/5427.