Bolsa de Doutorado Direto em Biologia do Envelhecimento

Direct Doctorate Fellowship in Aging Biology

Nº: 2071

Área de conhecimento: Genética

Field of knowledge: Genetics

Nº do processo FAPESP: 2017/01184-9

FAPESP process: 2017/01184-9

Título do projeto: CAMeLEOm: Análise Entre Espécies dos Efeitos Metabólicos, na Expectativa de Vida e Ômicas de Miméticos de Restrição Dietética

Project title: CAMeLEOm: Cross-Species Analysis of Metabolic, Lifespan Effects and Omics of Dietary Restriction Mimetics

Área de atuação: Biologia do Envelhecimento

Working area: Aging Biology

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador principal: Marcelo A. Mori

Principal investigator: Marcelo A. Mori

Unidade/Instituição: Instituto de Biologia/UNICAMP

Unit/Instituition: Instituto de Biologia/UNICAMP

Data limite para inscrições: 30/05/2018

Deadline for submissions: 2018-05-30

Publicado em: 04/04/2018

Publishing date: 2018-04-04

Localização: Rua Monteiro Lobato, 255 - Cidade Universitária, Campinas

Locale: Rua Monteiro Lobato, 255 - Cidade Universitária, Campinas

E-mail para inscrições: labe@unicamp.br

E-mail for proposal submission: labe@unicamp.br

  • Resumo Summary

    Uma vaga de doutorado direto está aberta para o projeto "Caracterização de Novos Genes Envolvidos no Envelhecimento e nos Mecanismos Evolutivamente Conservados de Miméticos de Restrição Dietética", vinculado ao Projeto Temático Processo 2017/01184-9, baseado em uma colaboração estabelecida entre o Laboratório de Biologia do Envelhecimento (LaBE), no Instituto de Biologia da Unicamp, e parceiros da Universidade de São Paulo, da Danish Technical University e dos Novo Nordisk Foundation Centers for Basic Metabolic Research and Biosustainability.

    Neste projeto, pretendemos delinear as redes moleculares comuns envolvidas no controle do tempo de vida e dos efeitos promotores de saúde da Restrição Dietética (RD) e de seus miméticos. Para alcançar este objetivo, projetamos um abordagem experimental para determinar as vias biologicamente relevantes afetadas por essas intervenções. Aproveitaremos a experiência multidisciplinar dos membros de nossa equipe para explorar os efeitos de intervenções dietéticas em vários modelos animais e em humanos. Resumidamente, analisaremos o metaboloma, o transcriptoma e o miRNoma de amostras obtidas de C. elegans, bem como tecido adiposo e soro de camundongos e humanos (saudáveis e / ou diabéticos do tipo 2) antes e após intervenções dietéticas. Também faremos análises metagenômicas da microbiota intestinal de camundongos e humanos, já que alterações no microbioma intestinal têm sido associadas aos efeitos da RD. Vamos correlacionar esses achados com a expectativa de vida e / ou perfil metabólico usando integração de dados através de abordagens de modelagem em escala genômica para identificar vias evolutivamente conservadas que são comumente afetadas pelas intervenções dietéticas. As vias relevantes serão escrutinadas usando modelos de ganho ou perda de função em C. elegans, camundongos e linhagens de células de mamíferos, fornecendo novos insights sobre como essas intervenções dietéticas afetam a saúde em múltiplos organismos, incluindo humanos. 

    O objetivo específico deste projeto de doutorado é tirar proveito da nossa análise inter-espécies de genes e metabólitos diferencialmente expressos em modelos animais e humanos submetidos a miméticos de restrição alimentar para priorizar e caracterizar vias envolvidas no controle do tempo de vida e dos efeitos metabólicos desses regimes dietéticos usando C. elegans como modelo. 

    Background

    A Unicamp é considerada a melhor universidade da América Latina segundo o Times Higher Education (THE). O Instituto de Biologia é uma das unidades de pesquisa mais bem financiadas da Unicamp e oferece infraestrutura completa para pesquisas de ponta. O LaBE está estabelecido no Departamento de Bioquímica e Biologia Tecidual - um Departamento bastante multidisciplinar em seus interesses de pesquisa. O LaBE é liderado pelo Professor Dr. Marcelo A. Mori e se concentra em desvendar novos mecanismos responsáveis pelo envelhecimento saudável. O LaBE dedicou esforços intensos nos últimos anos para entender os mecanismos moleculares responsáveis pelos efeitos benéficos da RD usando modelos animais como C. elegans e camundongos. O Prof. Mori e sua equipe foram pioneiros no estudo de como Dicer e miRNAs desempenham um papel essencial no tecido adiposo para controlar o envelhecimento, o metabolismo e os efeitos da RD. Você pode ler mais sobre o LaBE aqui http://morilab.wixsite.com/morilab e em nossas mídias sociais (LaBE Mori).

    Qualificações

    • Licenciatura em Biologia, Bioquímica, Ciências Farmacêuticas, Ciências Moleculares, Ciências Biomédicas, Neurociências, ou ciências relacionadas. OBS: Os alunos que estão fazendo o Mestrado são bem-vindos para se inscrever, mas a posição atual não pode ser preenchida por alunos com um mestrado válido no Brasil;
    • Excelente histórico científico em relação ao estágio de carreira;
    • Alguma experiência com Biologia Molecular e / ou Genética Molecular;
    • Bom conhecimento de Genética;
    • Alguns conhecimentos em planejamento experimental, cálculos de potência e avaliação estatística de dados experimentais;
    • Boas habilidades de comunicação em inglês, tanto escritas como orais;
    • Disponibilidade e vontade para viajar para a Dinamarca ou outros países por tempo prolongado (vários meses). 

    Condições

    A bolsa tem duração de três anos. O valor da bolsa e outros termos e condições para seu usufruto são definidos de acordo com as Normas para concessão de Bolsas de Doutorado Direto vinculadas a Temáticos da FAPESP (http://www.fapesp.br/5315). A faixa líquida é de R$ 1.988,10 a R $ 2.929,80 por mês (Nível I a III). As bolsas de doutorado estão isentas de impostos no Brasil. Um adicional de 30% será pago para despesas com pesquisa relacionadas ao projeto (reserva técnica). Custos de viagem e um salário adicional para o primeiro mês, caso o(a) candidato(a) venha a ser de fora de Campinas, podem vir a ser cobertos após negociação. A data de início é agosto de 2018. O(A) candidato(a) deverá ser selecionado(a) e matricular-se no Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular da UNICAMP. A UNICAMP é uma universidade pública e, portanto, não cobra taxas de seus estudantes. Mais informações sobre o programa de pós-graduação, acesse aqui: http://www.ib.unicamp.br/pos_genetica_molec/en/node/130.

    Procedimento de aplicação

    A aplicação deve ser enviada em inglês por e-mail (labe@unicamp.br) até 30 de abril de 2018, e deve incluir o seguinte: 

    • Carta de motivação (máximo de 1 página; At. Marcelo A. Mori);
    • Currículo;
    • Lista completa de publicações com indicação de fatores de impacto do periódico e número de citações na data da publicação;
    • Referências (nome e detalhes de contato de pelo menos duas referências). 

    As inscrições serão avaliadas por um comitê e os(as) candidatos(as) selecionados(as) serão escolhidos(as) para uma entrevista online com o Prof. Mori, que decidirá quem será selecionado(a). 

    Candidatos(as) altamente motivados(as) e ambiciosos(as) são encorajados(as) a candidatar-se. Experiência e excelente histórico serão considerados uma vantagem. Em todos os casos, a capacidade de realizar o trabalho será a principal consideração e, portanto, encorajamos todos - independentemente de seu histórico pessoal e status - a se candidatarem. 

    A direct doctorate position is available at the research project "Characterization of Novel Genes Involved in Aging and the Evolutionarily Conserved Mechanisms of Dietary Restriction Mimetics", linked to the Thematic Project under process number 2017/01184-9, based on an established collaboration between the Laboratory of Aging Biology (LaBE, at UNICAMP's Biology Institute) and partners at the University of São Paulo and the Danish Technical University and Novo Nordisk Foundation Centers for Basic Metabolic Research and Biosustainability.

    In this project, we aim to delineate the common molecular networks involved in the lifespan and health promoting effects of dietary restriction (DR) and its mimetics. To achieve this goal, we have designed a pipeline to determine biologically relevant pathways affected by these interventions. We will take advantage of the multidisciplinary expertise of the members of our team to explore the effects of specific dietary interventions in various animal models and in humans. Briefly, we will analyze the metabolome, transcriptome, and miRNome of samples obtained from C. elegans, as well as adipose tissue and serum from mice and humans (healthy and/or type 2 diabetics) before and after dietary interventions. We will also perform metagenomics analyses of the gut microbiota of mice and humans since changes in the gut microbiome have been associated with the effects of DR. We will correlate these findings with lifespan and/or metabolic profiling using data integration through genome-scale modeling approaches in order to identify evolutionarily conserved pathways that are commonly affected by dietary treatments. The relevant pathways will then be scrutinized using gain- or loss-of-function models in C. elegans, mice and mammalian cell lines, providing new insights into how these dietary interventions affect healthspan in multiple organisms, including humans. 

    The specific aim of this PhD project is to take advantage of our cross-species analysis of differentially expressed genes and metabolites in animal models and humans subjected to dietary restriction mimetics to prioritize and further characterize pathways involved in the lifespan and metabolic effects of these dietary regimens using C. elegans as a model.

    Background

    UNICAMP, the State University of Campinas, is ranked the best University in all Latin America according to Times Higher Education (THE). The Institute of Biology is one of the wealthiest research units at UNICAMP and offers complete infrastructure for cutting-edge research. The LaBE is established at the Department of Biochemistry and Tissue Biology – a rather multidisciplinary Department in its research interests. The LaBE is led by Assistant Professor Marcelo A. Mori and focuses on unraveling new mechanisms responsible for healthy aging. For what is relevant to this application, the LaBE has dedicated intense efforts in the past few years to understand the molecular mechanisms underlying the beneficial effects of DR using animal models such as C. elegans and mice. Prof. Mori and his team has performed pioneering work in the study of how adipose tissue Dicer and miRNAs play an essential role in aging, metabolism, and in the effects of DR. You can read more about the LaBE here http://morilab.wixsite.com/morilab and in our social media (LaBE Mori). 

    Qualifications

    • BSc degree in Biology, Biochemistry, Pharmaceutical Sciences, Molecular Sciences, Biomedical Sciences, Neurosciences, or related sciences. OBS: Students currently doing their Master’s are welcomed to apply, but the current position cannot be filled by students with a valid Master’s degree in Brazil.
    • Excellent scientific track record in relation to career stage;
    • Some experience with Molecular Biology and/or Molecular Genetics;
    • Good knowledge of Genetics;
    • Some knowledge in experimental planning, power calculations, and statistical evaluation of experimental data;
    • Good English communication skills, both written and oral;
    • Availability and willingness to travel to Denmark or other countries for extended time (several months).

    Conditions

    The fellowship has a three years duration. Stipend and other terms and conditions of appointment are set in accordance with FAPESP’s Direct Doctorate guidelines. The net salary range is R$ 1.988,10 to R$ 2.929,80 per month (Level I to III). PhD stipends are free of taxes in Brazil. An additional 30% will be paid for research expenses related to the project. Travel costs and an additional salary for the first month in case the candidate comes from outside Campinas can be covered after negotiation. Starting date is August 2018. The candidate will have to be selected and enroll in the Postgraduate Program in Genetics and Molecular Biology at UNICAMP. UNICAMP is a public University and therefore does not charge tuition fees. More information on the postgraduate program please access here: http://www.ib.unicamp.br/pos_genetica_molec/en/node/130.

    Application Procedure

    The application must be submitted in English via email (labe@unicamp.br) no later than April 30th, 2018, and must include the following: 

    • Letter of motivation (maximum of 1 page; Attn. Marcelo A. Mori);
    • Curriculum vitae;
    • Full list of publications with indication of citations and journal impact factors at publication date;
    • References (name and contact details of at least two references). 

    Applications will be evaluated by a committee and selected applicants will be chosen for an online interview with Prof. Mori, who will ultimately decide who will be selected. 

    Highly motivated and ambitious candidates are encouraged to apply. Experience and excellent track record will be considered a distinct advantage. In all cases, ability to perform the job will be the primary consideration, and thus we encourage all - regardless of their personal background and status - to apply.