Bolsa de PD em Biologia de Sistemas e Bioinformática

Post-doctoral Fellowship in Systems Biology and Bioinformatics,

Nº: 2200

Área de conhecimento: Ciência da Computação

Field of knowledge: Computer science

Nº do processo FAPESP: 2015/50040-4

FAPESP process: 2015/50040-4

Título do projeto: Centro de Excelência para Descoberta de Novos Alvos

Project title: Centre of Excellence in New Target Discovery

Área de atuação: Biologia de Sistemas, Bioinformática, Estatística

Working area: Systems Biology, Bioinformatics, Biostatistics

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Início: 03/09/2018

Start: 2018-09-03

Pesquisador principal: Ana Marisa Chudzinski Tavassi

Principal investigator: Ana Marisa Chudzinski Tavassi

Unidade/Instituição: Laboratório de Biologia Molecular/Instituto Butantan

Unit/Instituition: Laboratório de Biologia Molecular/Instituto Butantan

Data limite para inscrições: 30/07/2018

Deadline for submissions: 2018-07-30

Publicado em: 28/06/2018

Publishing date: 2018-06-28

Localização: Avenida Vital Brasil, 1500, São Paulo

Locale: Avenida Vital Brasil, 1500, São Paulo

E-mail para inscrições: centd@butantan.gov.br

E-mail for proposal submission: centd@butantan.gov.br

  • Resumo Summary

    O Centro de Excelência para Descoberta de Novos Alvos (CENTD), uma nova parceria entre a FAPESP, Glaxo-Smith Kline (GSK) e o Instituto Butantan, tem uma posição de pós-doutorado disponível no laboratório do CENTD no Instituto Butantan, em São Paulo, Brasil.

    O bolsista terá a oportunidade de trabalhar na identificação de alvos moleculares e de vias de sinalização relacionados a processos inflamatórios em osteoartrite, artrite reumatoide, remodelagem tecidual e câncer, doenças metabólicas e neurodegenerativas, utilizando como ferramentas toxinas de animais venenosos.

    Como requisitos, o candidato deve ter doutorado em Biologia de Sistemas, Bioinformática, Estatística ou áreas correlatas, ter pelo menos dois artigos como primeiro autor em revistas internacionais, motivação para resolver problemas biológicos complexos no campo da descoberta de alvos moleculares.

    O profissional desejado tem que ter experiência comprovada em análise e desenvolvimento (programação) de redes (grafos), cálculo de suas propriedades e algoritmos de reasoning, estatística e parâmetros informacionais (entropia, informação mútua, correlações, etc). É necessário ter experiência com alguns algoritmos de machine learning (como LASSO, random forest, entre outros), softwares relacionados à área, além de saber pesquisar em banco de dados biológicos e químicos. O trabalho será realizado em OS Linux, logo é necessário um bom conhecimento neste ambiente. As linguagens de programação adotadas são C, Python ou R (MATLAB e Java são bem-vindos). Conhecimentos em processamento paralelo e bigdata são diferenciais. Daremos preferência a um post-doc com sólidos conhecimentos em bioestatística e que tenha flexibilidade em interagir e trabalhar com pesquisadores em outros projetos, como bio-banco.

    Inglês fluente (comunicação e escrita), além da capacidade de trabalhar em um time interdisciplinar são requisitos essenciais.

    Os candidatos interessados devem apresentar seus pedidos incluindo: carta de apresentação descrevendo realizações de pesquisa, curriculum vitae e duas cartas de recomendação. Por favor, enviar esses documentos para Dra. Ana Marisa Chudzinski Tavassi (centd@butantan.gov.br; ana.tavassi@butantan.gov.br).

    Essa oportunidade está aberta a candidatos de todas as nacionalidades. O candidato selecionado receberá bolsa de pós-doutorado da FAPESP, no valor de R$ 7.174,80 mensais e um fundo de contingência de pesquisa, equivalente a 15% do valor anual da bolsa e que deve ser gasto em itens diretamente relacionados às atividades de pesquisa.

    Aqueles que precisarem se deslocar para a cidade onde está localizada a sede da instituição de pesquisa podem solicitar o benefício de assistência financeira de instalação, compreendendo:

    - Uma taxa mensal adicional a ser paga juntamente com o primeiro mês da bolsa;
    - Custos de transporte, se houver deslocamento por distância superior a 350 km (visite http://www.fapesp.br/270).

    Prazo para candidaturas: 30 de julho de 2018

    Data de início: 03 de setembro de 2018

    Duração: Inicialmente 2 anos, com opção de prorrogação.

    The Centre of Excellence in New Target Discovery (CENTD), a new partnership among São Paulo Research Foundation-FAPESP, Glaxo-Smith Kline (GSK) and Butantan Institute, has a postdoctoral position available in the Laboratory of Molecular Biology at Butantan Institute, São Paulo, Brazil.

    The postdoctoral fellow will have the opportunity to work in projects on identification/elucidation and validation of new targets/pathways related to inflammatory processes in osteoarthritis, rheumatoid arthritis, tissue remodeling and cancer, metabolic and neurodegenerative diseases, using as tools toxins from poisonous animals.

    As requirements, candidates must hold a PhD in Systems Biology, Bioinformatics, Biostatistics or related fields, with at least two articles as first author in international journals, motivation to solve biological complex problems in the field of molecular targets.

    Proven experience in networks analysis and development (programming), informational parameters (entropy, mutual information, correlation, etc.), graph parameters and statitics calculus. It is necessary experience with a few machine learning algorithms (like LASSO, random forest, etc.). All work will be developed in Linux, therefore a good knowledge in this OS is necessary. The adotped languages are C, Python and R (MATLAB and Java are welcome), softwares related to this area and experience in searching biological and proteomic databases. Knowledge in parallel processing and bigdata are differentials. We wil give preference to a post-doc with solid experience in biostatistics that has the flexibility to work and interact with other scientists working in others projects, like bio-bank.

    Fluent English (conversation and writing) and ability to work in an interdisciplinary team are essential requirements.

    Interested applicants should submit an application including a cover letter outlining research accomplishments, resumé, two recommendation letters. Please send the application to Ana Marisa Chudzinski Tavassi, PhD (centd@butantan.gov.br).

    This opportunity is open to candidates of any nationalities. The selected candidate will receive a FAPESP's Post-Doctoral fellowship in the amount of R$ 7.174,80 (around 2,115.00 USD) monthly and a research contingency fund, equivalent to 15% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.

    Installation financial assistance:

    Those who need to move to the city, where the headquarters of the research institution is located, may request the Installation financial assistance benefit, comprising:

    One (1) additional monthly fee to be paid along with the first month of the fellowship;

    Transportation costs, if any displacement by distance exceeding 350 km - see http://www.fapesp.br/en/5427.

    Deadline for applications: Jul, 30, 2018

    Starting date: Sep, 03, 2018

    Duration: Initially 2 years with option of further extension.