Bolsa de TT-IV em Bioinformática

Level 4-Technical Training Fellowship in Bioinformatics

Nº: 3102

Área de conhecimento: Matemática

Field of knowledge: Mathematics

Nº do processo FAPESP: 2013/07467-1

FAPESP process: 2013/07467-1

Título do projeto: CeTICS - Centro de Toxinas, Resposta Imune e Sinalização Celular

Project title: CeTICS - Center for Research on Toxins, Immune-Response and Cell Signaling

Área de atuação: Bioinformática

Working area: Bioinformatics

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador principal: Hugo Aguirre Armelin

Principal investigator: Hugo Aguirre Armelin

Unidade/Instituição: LECC/Instituto Butantan

Unit/Instituition: LECC/Instituto Butantan

Data limite para inscrições: 15/09/2019

Deadline for submissions: 2019-09-15

Publicado em: 19/08/2019

Publishing date: 2019-08-19

Localização: Av. Vital Brasil, 1500 - Butantã, São Paulo

Locale: Av. Vital Brasil, 1500 - Butantã, São Paulo

E-mail para inscrições: haarmeli@iq.usp.br

E-mail for proposal submission: haarmeli@iq.usp.br

  • Resumo Summary

    O CeTICS é um Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão (CEPID) apoiado pela FAPESP e sediado pelo Instituto Butantan, cujo objetivo principal é entender o comportamento dos sistemas biológicos com base em análises de dados de larga escala e redes de sinalização, para estudar mecanismos bioquímicos, moleculares e celulares de toxinas que têm potencial terapêutico.

    O CeTICS tem uma vaga de treinamento técnico (nível 4) com bolsa FAPESP. O bolsista atuará no desenvolvimento de metodologias e pipelines para análises de dados de larga escala de transcriptomas e de dados de proteomas de organismos venenosos. Sua atuação terá como objetivo principal a integração dos respectivos dados multi-ômicos para propor mapas estáticos de vias de sinalização significativas, as quais serão usadas para modelagem e simulações dos respectivos modelos dinâmicos.

    O candidato estará integrado ao grupo de trabalho do desenvolvimento da plataforma ARTSiN para Integração dos dados de larga escala e estudos de organismos não-modelo. 

    Os interessados favor enviarem currículo para meu email: milton.nishiyama@butantan.gov.br

    Em breve estaremos entrando em contato para agendarmos uma entrevista. 

    Requisitos:

    Essencial experiência em Linux, Bancos de dados MySQL, Programação em Python e R. Recomendável experiência em análises NGS (Sequenciamento de Nova Geração) e Proteômica por Espectrometria de Massas e inglês intermediário.

    A Bolsa TT-4 é voltada para especialista em Tecnologia de Informação (TI), com dois anos de experiência após a graduação ou título de mestrado na área de TI ou Bioinformática, sem vínculo empregatício, com dedicação integral. Mais detalhes em www.fapesp.br/3098.

    The CeTICS is a Research, Innovation and Dissemination Center supported by the São Paulo Research Foundation (FAPESP) and hosted by the Butantan Institute in São Paulo, Brazil, whose goal is to study and understand the behavior of biological systems based on high-throughput data and their relation with signaling networks, to study biochemical, molecular and cellular mechanisms and responses of toxins that have therapeutic potential.

    The CeTICS has one technical training position (level IV) available with fellowship from FAPESP. The Fellow will work in the development of methodologies and pipelines for analyzing high-throughput transcriptomic and proteomic data from venomous animals. The work will be focused mainly on the multi-omic data integration to propose static maps for signaling pathways, which will be used for modeling and simulations based on mathematical dynamic models.

    The candidate will be part of the ARTSiN platform group for the development, integration of -omics data and studies of non-model organisms. 

    The candidates must send the curriculum for the e-mail: milton.nishiyama@butantan.gov.br

    Requirements:

    Essential experience in Linux, MySQL Databases, Python and R programming languages. Recommended experience on NGS (New Generation Sequencing), Proteomics by Mass Spectrometry data analysis and Intermediate English.

    To apply for the TT-IV scholarship, the candidate must be graduated in Information Technology (IT) or correlated courses, with two years of experience after College graduation or master's degree in IT, Bioinformatics or correlated areas. The project will require fulltime dedication. More information can be found at www.fapesp.br/3098