Bolsa de PD em Imunogenética

Post-doctoral Fellowship in Imunogenetics

Nº: 3364

Área de conhecimento: Genética

Field of knowledge: Genetics

Nº do processo FAPESP: 2017/10780-4

FAPESP process: 2017/10780-4

Título do projeto: Efeito de mutações no gene Aire (Síndrome APS1) induzidas por CRISPR-Cas9 na conformação da proteína, no transcriptoma de células mTEC e na sua interação com timócitos

Project title: Effect of Aire gene mutations (APS1 Syndrome) induced by CRISPR-Cas9 in protein conformation, transcriptome of mTEC cells and its interaction with thymocytes

Área de atuação: Imunogenética

Working area: Imunogenetics

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador principal: Eduardo A Donadi

Principal investigator: Eduardo A Donadi

Unidade/Instituição: FMRP/USP

Unit/Instituition: FMRP/USP

Data limite para inscrições: 31/12/2019

Deadline for submissions: 2019-12-31

Publicado em: 29/11/2019

Publishing date: 2019-11-29

Localização: Av. Bandeirantes, 3900, Monte Alegre, Ribeirão Preto

Locale: Av. Bandeirantes, 3900, Monte Alegre, Ribeirão Preto

E-mail para inscrições: passos@usp.br

E-mail for proposal submission: passos@usp.br

  • Resumo Summary

    O Laboratório de Imunogenética Molecular da Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, SP, Brasil, está focado na desregulação da expressão gênica no timo e que pode estar associada à autoimunidade. As células estromais do timo (mTECs) são estudadas porque expressam ectopicamente todos os genes de antígenos de tecidos periféricos (PTAs) que caracterizam todos os órgãos do corpo. Esse fenômeno é denominado expressão gênica promíscua (PGE), e é controlada transcricionalmente pelos genes Aire e Fezf2. Esse processo está implicado na representação dos PTAs aos timócitos no timo, contribuindo com a seleção negativa. Nossa hipótese é que as mutações patogênicas de Aire estão associadas à desregulação da PGE, adesão mTEC-timócito e/ou migração.

    O candidato selecionado fará uso do sistema CRISPR-Cas9 para induzir mutações no gene Aire in vivo no timo de camundongos transgênicos Cas9 por eletroporação, separação de células TEC por citometria de fluxo e perfil do transcriptoma por RNA-Seq.

    O candidato ideal deverá ser colaborativo, trabalhador, com excelentes habilidades de comunicação e prática na supervisão de alunos, apresentando experiência anterior com eletroporação in vivo, separação de células tímicas por citometria de fluxo, extração e análise de RNA e análise e transcriptoma usando bioinformática focando isoformas de mRNA.

    Inscrição: Os candidatos devem submeter os seguintes documentos em PDF até 31/12/2019 para o Prof. Geraldo Passos (passos@usp.br):
    1) Carta de motivação explicando os motivos do seu interesse pelas atividades do projeto e também sobre as suas experiências prévias que contemplam os objetivos propostos.
    2) Duas cartas de recomendação de pesquisadores / professores.
    3) Curriculum vitae (PDF em no máximo 3 laudas) ou link do curriculum Lattes do CNPq (atualizado).”

    A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 7.373,10 mensais e Reserva Técnica equivalente a 15% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    The Molecular Immunogenetics Laboratory at University of São Paulo, Ribeirão Preto, Brazil, is focused on the dysregulation in the gene expression in the thymus and that could be associated to autoimmunity. The thymic stromal cells (mTECs) are highlighted because they ectopically express all peripheral tissue antigens (PTAs) genes characterizing all organs of the body. This phenomenon is termed promiscuous gene expression (PGE), which is transcriptionally controlled by the Aire and Fezf2 genes. This process is implicated in the self-representation of PTAs to developing thymocytes within the thymus contributing to the negative selection. Our hypothesis is that Aire pathogenic mutations are associated with dysregulation of PGE, mTEC-thymocyte adhesion and / or migration.

    The selected applicant will do use of CRISPR-Cas9 system to induce Aire mutations in vivo in the thymus of a transgenic Cas9 mouse by electroporation, separation of TEC cells by flow cytometry and further transcriptome profiling by RNA-Seq.

    The ideal candidate will be a collaborative, hardworking researcher who has excellent communication skills and practice in supervising students, presenting previous experience with in vivo electroporation of mice, separation of thymic cells by flow cytometry, RNA extraction and analysis and analysis of murine transcriptome by using bioinformatics pipeline focusing mRNA isoforms.

    Application: Applicants must submit the following PDF documents up to December 31 to Prof. Geraldo Passos (passos@usp.br):
    1) Motivation letter explaining the reasons for your interest in the project activities and also your previous experiences that meet the proposed objectives.
    2) Two letters of recommendation from researchers / professors.
    3) Curriculum vitae (PDF no more than 3 pages) or CNPq Lattes curriculum link (updated)

    This opportunity is open to candidates of any nationalities. The selected candidate will receive a Post-Doctoral fellowship from the São Paulo Research Foundation (FAPESP) in the amount of R$ 7,373.10 monthly and a research contingency fund, equivalent to 15% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.