Bolsa de PD em Virologia

Post-doctoral Fellowship in Virology

Nº: 3163

Área de conhecimento: Interdisciplinar

Field of knowledge: interdisciplinary

Nº do processo FAPESP: 2017/27131-9

FAPESP process: 2017/27131-9

Título do projeto: Estratégia integrada para o estudo de agentes infecciosos causadores de doenças emergentes e/ou negligenciadas transmitidas por vetores de impacto global

Project title: Integrated strategy for the study of infectious agents causing emerging and/or neglected diseases transmitted by vectors of global impact

Área de atuação: Virologia e Evolução Molecular

Working area: Virology/Molecular evolution

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Início: 01/11/2019

Start: 2019-11-01

Pesquisador principal: Paola Minoprio

Principal investigator: Paola Minoprio

Unidade/Instituição: Plataforma Cientifica Pasteur-USP/InovaUSP

Unit/Instituition: Plataforma Cientifica Pasteur-USP/InovaUSP

Data limite para inscrições: 15/10/2019

Deadline for submissions: 2019-10-15

Publicado em: 10/09/2019

Publishing date: 2019-09-10

Localização: Rua Prof. Lúcio Martins Rodrigues, 370, 4° andar, Bloco A, São Paulo

Locale: Rua Prof. Lúcio Martins Rodrigues, 370, 4° andar, Bloco A, São Paulo

E-mail para inscrições: paola.minoprio@pasteur.fr

E-mail for proposal submission: paola.minoprio@pasteur.fr

  • Resumo Summary

    A Plataforma Científica Pasteur-USP abre uma vaga de pós-doutorado no âmbito do Projeto Temático “Estratégia integrada para o estudo de agentes infecciosos causadores de doenças emergentes e/ou negligenciadas transmitidas por vetores de impacto global”.

    A vaga está relacionada ao subprojeto 3 do Temático denominado “Impacto das infecções por arbovírus emergentes e clones infecciosos virais, no estudo em tempo real das interações com seus hospedeiros em sistemas murinos”. O candidato selecionado receberá uma bolsa de pós-doutorado da FAPESP com duração de 24 meses.

    Nós estabelecemos e validamos tecnologias de imagem inovadoras para visualizar a dinâmica da infeção e da patologia causada por tripanosomátideos em hospedeiros vertebrados ou em processos de infecção celulares in vitro. Nesta nova etapa estamos propondo estudar a dinâmica da infecção causada pelo ZIKV com o uso de imagens quantitativas de bioluminescência e/ou fluorescência com resolução espacial de imagens bi- e tridimensionais combinada com técnicas de bioinformática para otimizar estudos in vitro e in vivo, em particular durante o comprometimento cerebral, usando modelos adaptados. A estratégia é desafiadora e permitirá de entender melhor a interação vírus-hospedeiro, com a construção uma cepa de ZIKV-BR bioluminescente/fluorescente, aplicação de ferramentas de imagem e de bioinformática.

    Objetivo geral do subprojeto 3
    Estudar os mecanismos adotados pelos arbovírus (por exemplo, vírus Zika) durante processo infeccioso in vitro e in vivo.

    Objetivos principais do subprojeto 3
    •  Explorar em tempo real a interação de ZIKV com hospedeiros vertebrados, verificando o efeito da replicação viral nos diversos tecidos infectáveis (i.e., sistema nervoso).
    •  Secundariamente, serão explorados os mecanismos imunológicos envolvidos no controle ou no estabelecimento da patogênese.

    1. Atividades e experiência requerida
    O candidato deve ter formação em Virologia ou áreas afins, de preferência com experiência em evolução molecular de arboviroses, com conhecimento interdisciplinar, capaz de auxiliar na orientação e co-orientação de alunos, auxiliar na redação e revisão de trabalhos científicos do grupo de pesquisa e trabalhar em ações que visem a transferência de tecnologia e conhecimento.

    2. Requisitos e habilidades requeridas para o candidato:
    - Possuir doutorado em Virologia ou áreas afins, finalizado a menos de sete anos;
    - Possuir Graduação em Ciências Biológicas, Biomedicina, Farmácia ou áreas afins;
    - Habilidade em trabalhar de forma independente e em colaboração com grupo de pesquisa multidisciplinar;
    - Produção científica em periódicos indexados;
    - Experiência comprovada em:

    • Pesquisas em áreas como Virologia Molecular, Genômica viral, Evolução viral;
    • Experiência em métodos de biologia molecular (Extração de RNA, qRT-PCR, sequenciamento de nova geração em plataforma Illumina);
    • Experiência em ferramentas de bioinformática;
    • Utilização de ferramentas estatísticas para processamento e análises de dados;
    • Difusão e transferência de conhecimento técnico-científico;
    • Serão priorizados candidatos com experiencia comprovada em ferramentas de bioinformática, tais como, montagem e anotação de genomas, metagenômica, análise composicional de ácidos nucleicos, análise filogenética, reconhecimento de padrões e análise estatística de dados multifatoriais.

    3. Documentos, prazos e forma de submissão:
    A inscrição deve ser feita via e-mail, enviando carta de apresentação, Curriculum Vitae ou Currículo Lattes e duas cartas de recomendações para a coordenadora do projeto, Paola Minoprio (paola.minoprio@pasteur.fr), até o dia 15 de outubro.

    Justificativas para o Plano em termos dos objetivos do Programa de Bolsas PD da FAPESP
    Contribuir para o conhecimento, desenvolvimento e adaptação tecnológica voltada ao entendimento de neuroinvasividade e neurodegeneração causada por infecções de patógenos; estabelecer e incrementar o treinamento de pesquisadores envolvidos no processo, bem como o desenvolvimento de habilidades específicas; formação de recursos humanos altamente qualificados para pesquisa de ponta no Brasil; colocar o Brasil em evidência como fomentador de pesquisa de qualidade e relevância no cenário científico mundial.

    A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 7.373,10 mensais e Reserva Técnica equivalente a 15% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    The Scientific Platform Pasteur - USP announces the opening of a postdoctoral position within the Thematic Project “Integrated strategy for the study of infectious agents causing emerging and/or neglected diseases transmitted by vectors of global impact”.

    The vacancy is related to Subproject 3 of Thematic entitled "Impact of Emerging Arbovirus Infections and Viral Infectious Clones, in the real-time study of interactions with their hosts in murine systems". The selected candidate will receive a FAPESP postdoctoral fellowship lasting 24 months.

    We have established and validated innovative imaging technologies to visualize the dynamics of trypanosome infection and pathology in vertebrate hosts or in vitro cellular infection processes. In this new stage we are proposing to study the dynamics of ZIKV infection with the use of quantitative bioluminescence and/or fluorescence images with spatial resolution of two- and three-dimensional images combined with bioinformatics techniques to optimize in vitro and in vivo studies, in particular, during brain impairment, using adapted models. The strategy is challenging and will allow us to better understand the virus-host interaction by building a bioluminescent/fluorescent ZIKV-BR strain, applying imaging and bioinformatics tools.

    General objective of subproject 3
    To study the mechanisms adopted by arboviruses (e.g., ZIKV) during in vitro and in vivo infectious process.

    Main objectives of subproject 3
    • Explore in real time the interaction of ZIKV with vertebrate hosts by checking the effect of viral replication on various infectious tissues (i.e., nervous system).
    • Secondarily, the immunological mechanisms involved in controlling or establishing the pathogenesis will be explored.

    1. Activities and experience required
    Applicants should have a background in Virology or related fields, preferably with experience on molecular evolution of arbovirus, with interdisciplinary knowledge, able to assist in the orientation and co-orientation of students, assist in the writing and review of scientific work of the research group and work on actions aimed at technology and knowledge transfer.

    2. Requirements and skills required for the applicant:
    - Have a doctorate in Virology or related areas, completed less than seven years;
    - Have a degree in Biological Sciences, Biomedicine, Pharmacy or related areas;
    - Ability to work independently and in collaboration with a multidisciplinary research group;
    - Scientific production in indexed journals;
    - Proven experience in:

    • Research in areas such as Molecular Virology, Viral Genomics, Viral Evolution;
    • Experience in molecular biology methods (RNA extraction, qRT-PCR, next generation sequencing in Illumina platform);
    • Experience in bioinformatics tools;
    • Use of statistical tools for data processing and analysis;
    • Dissemination and transfer of technical-scientific knowledge;
    • Priority will be given to candidates with proven experience in bioinformatics tools such as genome assembly and annotation, metagenomics, nucleic acid compositional analysis, phylogenetic analysis and pattern recognition, and statistical analysis of multifactorial data.

    3. Documents, deadlines and form of submission:
    Applications must be submitted via e-mail, sending a cover letter, Curriculum Vitae or Curriculum Lattes and two letters of recommendation to the project coordinator, Paola Minoprio (paola.minoprio@pasteur.fr), by October 15, 2019.

    Rationale for the Plan in terms of the objectives of the FAPESP postdoctoral Scholarship Program

    Contribute to the knowledge, development and technological adaptation focused on the understanding of neuroinvasion and neurodegeneration caused by pathogen infections; to establish and increase the training of researchers involved in the process, as well as the development of specific skills; highly qualified human resources training for cutting-edge research in Brazil; put Brazil in evidence as a promoter of quality research and relevance in the world scientific scenario.

    The main objective of the subproject is to study viral infection in animal models (intra-host level) caused by arboviruses such as the Zika virus (ZIKV) during the infection process. The research will serve as a basis for interface with other subprojects of the thematic study involving infections with infectious clones of ZIKV, modified by reporter genes for analysis of the infectious process in vitro and in vivo by 2D and 3D imaging.

    The fellow will participate in the investigation of the interaction of animal and human pathogenic microorganisms with hosts through study of genetic diversity and real time images.

    This opportunity is open to candidates of any nationalities. The selected candidate will receive a FAPESP’s Post-Doctoral fellowship in the amount of BRL 7.373,10 monthly and a research contingency fund, equivalent to 15% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.