Bolsa de TT-III em Sequenciamento de RNA, Proteômica e Bioinformática

Level 3-Technical Training Fellowship in RNA Sequencing, Proteomics and Bioinformatics

Nº: 5619

Área de conhecimento: Saúde Coletiva

Field of knowledge: Collective health

Nº do processo FAPESP: 2021/05975-6

FAPESP process: 2021/05975-6

Título do projeto: Anticorpos contra o SARS-CoV-2 do plasma de vacinados: dinâmica da resposta humoral, sequenciamento, expressão e efetividade dos recombinantes para terapia e diagnóstico

Project title: Anti-SARS-CoV-2 antibodies in the plasma of vaccinees: dynamics of humoral response, sequencing, expression and effectiveness of recombinants for therapy and diagnosis

Área de atuação: Sequenciamento de RNA, Proteômica e Bioinformática

Working area: RNA Sequencing, Proteomics and Bioinformatics

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador responsável: Alexandre Keiji Tashima

Principal investigator: Alexandre Keiji Tashima

Unidade/Instituição: EPM-Unifesp

Unit/Instituition: EPM-Unifesp

Data limite para inscrições: 16/12/2022

Deadline for submissions: 2022-12-16

Publicado em: 28/11/2022

Publishing date: 2022-11-28

Localização: Rua Botucatu, 862, São Paulo

Locale: Rua Botucatu, 862, São Paulo

E-mail para inscrições: lpp.bioq.unifesp@gmail.com

E-mail for proposal submission: lpp.bioq.unifesp@gmail.com

  • Resumo

    Seleção para bolsa de Treinamento Técnico nível 3 (TT-III) voltada a candidatos graduados do nível superior das áreas de Tecnologia, Biotecnologia, Ciências Biológicas, Ciências Biomédicas, Química, Engenharia Química e áreas afins, com interesse em sequenciamento de RNA, Proteômica e Bioinformática. O objetivo geral do projeto é sequenciar e expressar anticorpos recombinantes específicos contra o SARS-CoV-2 e avaliar suas capacidades de neutralização.

    O(a) bolsista receberá treinamento para realizar a preparação de amplicons de células únicas, que codificam cadeias pesadas e leves de anticorpos, para sequenciamento de long-reads na plataforma MinION (Oxford Nanopore Technologies). Também receberá treinamento em técnicas de análise proteômica e sobre as plataformas e workflows de Bioinformática utilizados para a montagem de sequências e análise dos dados. Contribuirá com o desenvolvimento de metodologias computacionais para a montagem e análise de sequências oriundas de células únicas.

    Deve ter experiência prévia em programação (em Python, R, C++, etc.), Linux e interesse em Bioinformática. Para se inscrever, enviar carta de motivação e Lattes para o e-mail lpp.bioq.unifesp@gmail.com.

    Mais informações sobre requisitos e benefícios da Bolsa FAPESP TT-III estão em fapesp.br/3098 e fapesp.br/3162.