Bolsa de PD em Biologia Molecular

Post-Doctoral Fellowship in Molecular Biology

Nº: 4775

Área de conhecimento: Bioquímica

Field of knowledge: Biochemistry

Nº do processo FAPESP: 2020/13139-0

FAPESP process: 2020/13139-0

Título do projeto: Centro de excelência na descoberta de novos alvos

Project title: Centre of Excellence for Research in Target Discovery

Área de atuação: Biologia Molecular

Working area: Molecular Biology

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador responsável: Ana Marisa Chudzinski-Tavassi

Principal investigator: Ana Marisa Chudzinski-Tavassi

Unidade/Instituição: Laboratório Especial CENTD / Instituto Butantan

Unit/Instituition: Laboratório Especial CENTD / Instituto Butantan

Data limite para inscrições: 15/01/2022

Deadline for submissions: 2022-01-15

Publicado em: 20/12/2021

Publishing date: 2021-12-20

Localização: Av. Dr. Vital Brasil, 1500, São Paulo

Locale: Av. Dr. Vital Brasil, 1500, São Paulo

E-mail para inscrições: anachudzinski@butantan.gov.br

E-mail for proposal submission: anachudzinski@butantan.gov.br

  • Resumo Summary

    O bolsista terá a oportunidade de trabalhar na identificação de alvos moleculares e validação de peptídeos anti-inflamatórios aplicando técnicas de proteômica por espectrometria de massas.

    Espera-se experiência comprovada em cultura celular, preparação de amostras (extração de proteínas, digestão em solução e in-gel, derivatização química, dessalinização, descomplexação de amostras de proteínas e peptídeos por cromatografia de troca iônica e fase reversa) para as análises proteômicas a partir de abordagens do tipo shotgun bottom-up a fins de caracterizar e quantificar as proteínas-alvo.

    O candidato deverá ter experiência conceitual/prática em sistemas de nanocromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas de alta resolução e análise dos dados gerados pela plataforma de LC-MS/MS, preferencialmente no uso dos instrumentos EASY-nLC1200 (Thermo Scientific) acoplado ao espectrômetro de massas Q Exactive Plus (Thermo Scientific). Preferencialmente serão selecionados os candidatos que dominem as principais ferramentas de busca em banco de dados para as análises direcionadas ao estudo de proteomas (PEAKS MaxQuant, Skyline, Mascot, TPP, Sequest, etc.) e familiaridade com Quimeoproteômica. Experiência com bioinformática em linguagem R é também desejada.

    O candidato selecionado trabalhará no Centro de Excelência para Descoberta de Alvos Moleculares (CENTD), um dos Centros de Pesquisa em Engenharia (CPEs) apoiados pela FAPESP, co-financiado pela GSK e hospedado no Instituto Butantan.

    A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 7.373,10 mensais e Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    The candidate will have the opportunity to work in target identification and validation of anti-inflammatory peptides, applying mass spectrometry-based proteomic techniques.

    Verified experience with cell culture, sample preparation (protein extraction, in-solution and in-gel digestion, chemical derivatization, desalting, protein and peptide sample descomplexation by ion-exchange or reverse-phase chromatography) to proteomic analysis, from shotgun bottom-up approaches, for targets characterization and quantification, is required.

    The candidate must have practice/conceptual experience with liquid nano-chromatography systems coupled to high-resolution mass spectrometer, and high throughput data analysis generated by the nLC-MS/MS platform, preferable with EASY-nLC1200 and QExactive plus instrument Plus (Thermo Scientific). As differential, candidates who master the main database search tools related to proteomes (PEAKS MaxQuant, Skyline, Mascot, TPP, Sequest, etc.) and basic knowledge of Chemoproteomic will be selected. Experience with bioinformatics with R language is a plus.

    The selected candidate will work at the Centre of Excellence in New Target Discovery (CENTD), one of the Engineering Research Centers (ERCs) supported by the São Paulo Research Foundation (FAPESP), co-funded by GSK and hosted at the Butantan Institute in São Paulo, Brazil.

    This opportunity is open to candidates of any nationality. The selected candidate will receive a FAPESP’s Post-Doctoral fellowship in the amount of R$ 7,373.10 monthly and a research contingency fund, equivalent to 10% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.