Bolsa de PD em Biologia Molecular e Bioinformática

Post-Doctoral Fellowship in Molecular Biology and Bioinformatics

Nº: 5479

Área de conhecimento: Genética

Field of knowledge: Genetics

Nº do processo FAPESP: 2021/06866-6

FAPESP process: 2021/06866-6

Título do projeto: Integrando ferramentas e disciplinas para entender o futuro dos corais de águas-rasas do Atlântico Sul Ocidental em um planeta em mudanças

Project title: Integrating tools and disciplines to understand the future of Southwestern Atlantic shallow-water corals in a changing planet

Área de atuação: Biologia Molecular e Bioinformática

Working area: Molecular Biology and Bioinformatics

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Início: 01/11/2022

Start: 2022-11-01

Pesquisador responsável: Marcelo Visentini Kitahara

Principal investigator: Marcelo Visentini Kitahara

Unidade/Instituição: Centro de Biologia Marinha da Universidade de São Paulo (CEBIMar-USP)

Unit/Instituition: Centro de Biologia Marinha da Universidade de São Paulo (CEBIMar-USP)

Data limite para inscrições: 20/10/2022

Deadline for submissions: 2022-10-20

Publicado em: 04/10/2022

Publishing date: 2022-10-04

Localização: Rodovia Manoel Hipólito do Rego, km 131,5, São Sebastião

Locale: Rodovia Manoel Hipólito do Rego, km 131,5, São Sebastião

E-mail para inscrições: kitahara@usp.br

E-mail for proposal submission: kitahara@usp.br

  • Resumo Summary

    Os objetivos desta linha de pesquisa são o de avançar o conhecimento em relação aos seguintes tópicos:

    a) Como estão estruturadas as populações de corais brasileiros?

    b) A conectividade populacional pode ser correlacionada com estratégias reprodutivas, duração das larvas no plâncton ou estratégia trófica?

    c) Existe prevalência de genótipos para cada localidade amostrada?

    d) As áreas marinhas protegidas estão sendo eficazes na proteção da diversidade genética de corais?

    e) Qual a diversidade genética das populações marginais?

    f) Padrões de conectividade genética estão correlacionados com parâmetros ambientais como temperatura e luminosidade?

    g) Os recifes do Brasil são compostos de fauna relíquia?

    Interessados(as) deverão enviar e-mail para kitahara@usp.br até 20/10/2022, contendo os documentos (PDF):

    a) Carta de recomendação;
    b) Súmula curricular;
    c) Histórico de experiência na utilização de técnicas moleculares (preparação de bibliotecas para sequenciamento na plataforma Illumina);
    d) Histórico de experiência com desenvolvimento de pipelines para análises de dados de sequenciamento DNA e RNA em larga escala; e
    e) Experiência com uma ou mais linguagens de programação (ex.: Python, Perl, R, etc).

    A vaga está aberta a brasileiros(as) e estrangeiros(as). O(A) selecionado(a) receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 8.479,20 mensais e Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    The objectives of this research line are to advance the current knowledge regarding:

    a) How are Brazilian coral populations structured?

    b) Can population connectivity be correlated with reproductive strategies, larval plankton duration, or trophic strategy?

    c) Is there a prevalence of genotypes for each sampled location?

    d) Are marine protected areas effective in protecting coral genetic diversity?

    e) How is the genetic diversity of marginal populations?

    f) Are genetic connectivity patterns correlated with environmental parameters such as temperature and luminosity?

    g) Are Brazilian reefs composed of relict fauna?

    Interested candidates should send an email to kitahara@usp.br until 10/20/2022, containing the documents (PDF): a) letter of recommendation; b) résumé; c) previous experiences in the use of molecular techniques (preparation of libraries for sequencing on the Illumina platform); d) previous experiences with pipeline development for large-scale DNA and RNA sequencing data analysis; e) experience one or more programming languages (eg. Python, Perl, R, etc).

    The fellow will be based in the Center of Marine Biology  (CEBImar) of the University of São Paulo (USP) in São Sebastião, São Paulo state, Brazil.

    The position is open to candidates of any nationality. The selected person will receive a Post-Doctoral Scholarship from the São Paulo Research Foundation (FAPESP) in the amount of R$ 8,479.20/monthly and a research contingency fund, equivalent to 10% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.