Bolsa de PD em Ciência da Computação em Medicina

Post-Doctoral Fellowship in Computer Science in Medicine

Nº: 5564

Área de conhecimento: Ciência da Computação

Field of knowledge: Computer science

Nº do processo FAPESP: 2021/06137-4

FAPESP process: 2021/06137-4

Título do projeto: Prevendo Eventos Cardiovasculares Usando Aprendizado de Máquina

Project title: Predicting Cardiovascular Events Using Machine Learning

Área de atuação: Ciência da Computação em Medicina

Working area: Computer Science in Medicine

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador responsável: Paulo Mazzoncini de Azevedo Marques

Principal investigator: Paulo Mazzoncini de Azevedo Marques

Unidade/Instituição: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP-USP)

Unit/Instituition: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP-USP)

Data limite para inscrições: 25/11/2022

Deadline for submissions: 2022-11-25

Publicado em: 04/11/2022

Publishing date: 2022-11-04

Localização: Rua Tenente Catão Roxo, 3900 (Centro de Ciências das Imagens e Física Médica – HC-FMRP-USP, 2º andar), Ribeirão Preto

Locale: Rua Tenente Catão Roxo, 3900 (Centro de Ciências das Imagens e Física Médica – HC-FMRP-USP, 2º andar), Ribeirão Preto

E-mail para inscrições: pmarques@fmrp.usp.br

E-mail for proposal submission: pmarques@fmrp.usp.br

  • Resumo Summary

    Buscamos candidatos para trabalhar com aprendizado federado para validação de modelos de aprendizado de máquina treinados em diferentes redes de hospitais. Os candidatos devem ter doutorado recente em Ciências da Computação, Engenharia Biomédica ou área afim, com formação em bases de dados, mineração de dados, aprendizado de máquina, HL7 e OMOP-CDM. Mais informações sobre o projeto de pesquisa estão em https://precareml.github.io/#! e https://bv.fapesp.br/pt/auxilios/110451.

    A pesquisa de Pós-Doutorado será desenvolvida no Hospital das Clínicas (HC) da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (FMRP-USP).

    Responsabilidades esperadas do bolsista:

    - Organização de coorte e padronização de dados conforme OMOP-CDM;
    - Validação e adaptação de modelo de ML utilizando aprendizado federado;
    - Implantação de modelo de ML para teste em ambiente clínico.

    Inscrições:

    Enviar e-mail para pmarques@fmrp.usp.br indicando “Seleção para bolsa Pos-Doc: Projeto PRE-CARE ML” no campo “Assunto” e contendo os seguintes itens anexados:

    - CV do candidato, indicando formação, produção científica, projetos dos quais participou;
    - Duas cartas de recomendação;
    - Uma breve declaração de interesse na pesquisa, ressaltando suas habilidades relacionadas.

    A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O valor da bolsa é de R$ 8.479,20 mensais, com duração de até 27 meses, e inclui Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    We are looking for candidates to work with federated learning to validate machine learning models trained in different hospital networks. Candidates must have a recent Ph.D. in Computer Science, Biomedical Engineering, or a related field, with a background in databases, data mining, machine learning, HL7, and OMOP-CDM. More information about the research project is at https://precareml.github.io/#! and https://bv.fapesp.br/en/auxilios/110451.

    The Post-Doctoral research will be carried out at the Hospital das Clínicas (HC), the general and teaching hospital run by the Ribeirão Preto Medical School of the University of São Paulo (FMRP-USP) in Brazil.

    Expected Scholarship Responsibilities:

    - Cohort organization and data standardization according to OMOP-CDM;
    - Validation and adaptation of ML model using federated learning;
    - Deployment of an ML model for testing in a clinical environment.

    Submission:

    Send an email to pmarques@fmrp.usp.br with the subject field indicating: “Selection for Post-Doc Scholarship: PRE-CARE ML Project.” Please send the following documents attached to the email:

    - Candidate's CV, indicating training, scientific production, projects in which he participated;
    - Two letters of recommendation;
    - A brief statement of interest in the research, highlighting your related skills.

    This opportunity is open to candidates of any nationality. The selected candidate will receive a Post-Doctoral fellowship from the São Paulo Research Foundation (FAPESP) in the amount of BRL8,479.20 per month, with a duration of up to 27 months. It also includes a research contingency fund, equivalent to 10% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.