Bolsa de Doutorado Direto em Biologia Molecular / Bioinformática

Direct Doctorate Fellowship in Molecular Biology / Bioinformatics

Nº: 7656

Área de conhecimento: Interdisciplinar

Field of knowledge: interdisciplinary

Nº do processo FAPESP: 2023/08989-3

FAPESP process: 2023/08989-3

Título do projeto: Análises bioinformáticas de RNAs codificantes e não codificantes em Brevipalpus yothersi e seu papel na interação com o vírus da leprose dos citros C e na resposta a acaricidas

Project title: Bioinformatic analyses of coding and non-coding RNAs in Brevipalpus yothersi and their role on the interaction with Citrus leprosis virus C and the response to acaricides

Área de atuação: Genômica Computacional, Transcriptômica, Acarologia e Virologia

Working area: Computational Genomics, Transcriptomics, Acarology, Virology

Quantidade de vagas: 1

Positions: 1

Pesquisador responsável: Daniel Gonzalez

Principal investigator: Daniel Gonzalez

Unidade/Instituição: Instituto Biológico (IB/APTA/SAASP)

Unit/Instituition: Instituto Biológico (IB/APTA/SAASP)

Data limite para inscrições: 31/01/2025

Deadline for submissions: 2025-01-31

Publicado em: 04/12/2024

Publishing date: 2024-12-04

Localização: Av. Conselheiro Rodrigues Alves, 1252 (Unidade Referência em Biologia Molecular Aplicada), São Paulo

Locale: Av. Conselheiro Rodrigues Alves, 1252 (Unidade Referência em Biologia Molecular Aplicada), São Paulo

E-mail para inscrições: institutobiologico.occupier583@passinbox.com

E-mail for proposal submission: institutobiologico.occupier583@passinbox.com

  • Resumo

    Oportunidade de Doutorado Direto com Bolsa FAPESP de 4 anos para candidatos com interesse em realizar pesquisas multidisciplinares de ponta nas áreas de Genômica Computacional, Transcriptômica e Virologia em ácaros, e com:

    • Excelente histórico acadêmico;
    • Treinamento em bioinformática, ciência da computação e áreas relacionadas;
    • Familiaridade com ambientes Linux OS, shell scripting, uma linguagem de programação (Python preferencial) e R.;
    • Pelo menos uma iniciação científica durante a graduação e/ou mestrado será um diferencial.

    Responsabilidades do bolsista e oportunidades de aprendizado:

    - Manipulação de dados de sequenciamento de DNA de última geração;
    - Anotação (identificação genética) do genoma do ácaro;
    - Análises de expressão gênica e montagem de transcriptoma de novo de RNAs codificadores e não codificadores;
    - Estratégias de mapeamento para dados de RNA pequeno, anotação de loci MIRNA e análise de RNAs pequenos que interagem com piwi;
    - Identificação de RNAs pequenos interferentes antisense naturais;
    - Identificação de eventos de back-splicing e caracterização de RNAs circulares;
    - Análise de viroma, montagem e anotação do genoma viral.

    Os candidatos interessados ??devem enviar seu CV, histórico acadêmico e carta de motivação para institutobiologico.occupier583@passinbox.com com o assunto “Fellowship DD”. As inscrições serão avaliadas até que a vaga seja preenchida.

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