Bolsa de PD em Genômica de Abelhas

Post-Doctoral Fellowship in Bee Genomics

• Atividades e contexto Activities and context

  O(A) bolsista atuará na geração e integração de dados genômicos e multiômicos para aprimorar a montagem e a anotação funcional de genomas de diferentes espécies de abelhas. As atividades incluem coleta e processamento de material biológico, extração de DNA/RNA e preparo de amostras/bibliotecas; geração e análise de dados Hi-C, RNA-seq, TSS-seq e ATAC-seq; integração com dados PacBio HiFi e Illumina; refinamento de montagens; desenvolvimento de pipelines reprodutíveis; e apoio à formação de estudantes.

  The fellow will work on the generation and integration of genomic and multi-omic data to improve genome assembly and functional annotation across different bee species. Activities include collection and processing of biological material, DNA/RNA extraction and sample/library preparation; generation and analysis of Hi-C, RNA-seq, TSS-seq and ATAC-seq data; integration with PacBio HiFi and Illumina data; genome assembly refinement; development of reproducible pipelines; and support for student training.

• Requisitos obrigatórios Mandatory requirements

  Doutorado concluído há menos de 7 anos em Genética, Genômica, Bioinformática, Biologia Molecular, Biologia Evolutiva ou áreas afins, conforme normas da FAPESP; experiência em biologia molecular, incluindo processamento de material biológico e extração de DNA/RNA; experiência em geração e/ou análise de dados de sequenciamento; domínio de ambiente Linux e programação em R e/ou Python; experiência em análises genômicas ou transcriptômicas; bom domínio de inglês e produção científica compatível com o estágio de carreira.

  PhD obtained within the past 7 years in Genetics, Genomics, Bioinformatics, Molecular Biology, Evolutionary Biology or related fields, in accordance with FAPESP rules; experience in molecular biology, including biological sample processing and DNA/RNA extraction; experience in the generation and/or analysis of sequencing data; proficiency in Linux and R and/or Python; experience in genomic or transcriptomic analyses; good command of English; and a scientific record consistent with career stage.

• Requisitos desejáveis Desirable requirements

  Serão valorizadas experiências em montagem e anotação de genomas, dados long-read e/ou Hi-C, RNA-seq, ATAC-seq, integração multiômica, genômica comparativa/evolutiva e desenvolvimento de workflows reprodutíveis. Familiaridade com biologia de abelhas ou outros insetos sociais e com evolução da socialidade/eussocialidade, bem como experiência na formação de estudantes, será considerada um diferencial.

  Experience in genome assembly and annotation, long-read and/or Hi-C data, RNA-seq, ATAC-seq, multi-omics integration, comparative/evolutionary genomics, and development of reproducible workflows will be valued. Familiarity with bee biology or other social insects and with the evolution of sociality/eusociality, as well as experience in student training or supervision, will be considered an advantage.

• Como se candidatar How to apply

  Enviar: (1) CV com lista de publicações; (2) Carta de interesse, de até 2 páginas, descrevendo experiência prévia e aderência ao projeto; (3) Comprovante de conclusão do doutorado e histórico escolar do doutorado; e (4) Nome e contato de duas referências acadêmicas. Assunto do e-mail: “Pos-doc Genômica de Abelhas – FAPESP”. Candidatos(as) pré-selecionados(as) serão convidados(as) para entrevista on-line.

  Submit: (1) CV including publication list; (2) A motivation letter of up to 2 pages describing previous experience and fit with the project; (3) Proof of PhD completion and PhD academic transcript; and (4) Names and contact details of two academic references. Email subject: “Postdoc Bee Genomics – FAPESP”. Shortlisted candidates will be invited to an online interview.