Bolsa de PD em Biologia Molecular, Bioinformática e Farmacogenômica

Post-Doctoral Fellowship in Molecular Biology, Bioinformatics and Pharmacogenomics

Nº: 5639

Área de conhecimento: Farmácia

Field of knowledge: Pharmacy

Nº do processo FAPESP: 2016/12899-6

FAPESP process: 2016/12899-6

Título do projeto: Caracterização genômica, epigenômica e farmacogenômica de portadores de Hipercolesterolemia Familial na população brasileira

Project title: Genomic, epigenomic and pharmacogenomic characterization of patients with Familial Hypercholesterolemia in the Brazilian population

Área de atuação: Biologia Molecular, Bioinformática e Farmacogenômica

Working area: Molecular Biology, Bioinformatics and Pharmacogenomics

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Início: 01/03/2023

Start: 2023-03-01

Pesquisador responsável: Mario Hiroyuki Hirata

Principal investigator: Mario Hiroyuki Hirata

Unidade/Instituição: Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade de São Paulo (FCF-USP)

Unit/Instituition: Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade de São Paulo (FCF-USP)

Data limite para inscrições: 05/01/2023

Deadline for submissions: 2023-01-05

Publicado em: 06/12/2022

Publishing date: 2022-12-06

Localização: Av. Prof. Lineu Prestes, 580 (Bloco 17, sala 104), Butantã, São Paulo

Locale: Av. Prof. Lineu Prestes, 580 (Bloco 17, sala 104), Butantã, São Paulo

E-mail para inscrições: mhhirata@usp.br

E-mail for proposal submission: mhhirata@usp.br

  • Resumo Summary

    Uma oportunidade de pós-doutorado está disponível no Laboratório de Biologia Molecular Aplicada ao Diagnóstico e Farmacogenômica (LBMAD) na Faculdade de Ciências Farmacêuticas da USP. O objetivo principal é desenvolver um fluxo de trabalho para análise de dados de sequenciamento de DNA e RNA, obtidos de pacientes com Hipercolesterolemia Familiar (HF), utilizando ferramentas de bioinformática. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 8.479,20 mensais e Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa. (fapesp.br/bolsas/pd).

    Qualidades e experiência necessárias:

    a. Ter concluído o doutorado há menos de 7 anos;
    b. Experiência prévia em biologia molecular, bioinformática, análise de dados de Sequenciamento de Nova Geração (NGS), microarranjo, além de experiências em farmacogenômica, epigenômica;
    c. Proficiência em pelo menos uma linguagem de programação (Python e/ou R), familiaridade com programas utilizados na chamada de variantes genéticas como FastQC, GATK, BWA-MEM, ANNOVAR, VEP entre outros.

    Os candidatos deverão enviar os seguintes documentos (em formato PDF) ao Prof. Dr. Mario H. Hirata (mhhirata@usp.br):

    a. Currículo Lattes atualizado;
    b. Carta de interesse;
    c. Duas cartas de recomendação.

    A postdoctoral opportunity is available at the Laboratory of Molecular Biology Applied to Diagnosis and Pharmacogenomics (LBMAD) at the School of Pharmaceutical Sciences of the University of São Paulo (FCF-USP) in Brazil. The main objective is to develop a workflow for analysis of DNA and RNA sequencing data, obtained from patients with Familial Hypercholesterolemia (FH), using bioinformatics tools. The selected candidate will receive a Postdoctoral Fellowship from the São Paulo Research Foundation (FAPESP) in the amount of BRL 8,479.20 per month and a research contingency fund, equivalent to 10% of the annual value of the scholarship to meet unforeseen expenses directly related to the research activity (fapesp.br/en/postdoc).

    Required Qualities and Experience:

    A. Have completed your PhD less than 7 years ago;
    B. Previous experience in molecular biology, bioinformatics, Next Generation Sequencing (NGS) data analysis, microarray, as well as experiences in pharmacogenomics, epigenomics;
    C. Proficiency in at least one programming language (Python and/or R), familiarity with programs used to call genetic variants such as FastQC, GATK, BWA-MEM, ANNOVAR, VEP, among others.

    Applicants should send the following documents (in PDF format) to Prof. Dr. Mario H. Hirata (mhhirata@usp.br):

    A. Curriculum Vitae;
    B. Cover Letter;
    C. Two letters of recommendation.