Bolsa de PD em Biologia Molecular / Genética / Genômica

Post-Doctoral Fellowship in Molecular Biology / Genetics / Genomics

Nº: 9311

Área de conhecimento: Genética

Field of knowledge: Genetics

Nº do processo FAPESP: 2022/09319-9

FAPESP process: 2022/09319-9

Título do projeto: Centro de Ciência para o Desenvolvimento em Agricultura Digital - CCD-AD/SemeAr

Project title: Science Center for Development in Digital Agriculture – SCD-AD/SemeAr

Área de atuação: Biologia Molecular / Genética / Genômica

Working area: Molecular Biology / Genetics / Genomics

Quantidade de vagas: 1

Positions: 1

Valor da bolsa: R$ 12.570,00 (consulte os valores de Bolsas da FAPESP em fapesp.br/valores/bolsasnopais).

Value: R$ 12.570,00 (consulte os valores de Bolsas da FAPESP em fapesp.br/valores/bolsasnopais).

Pesquisador responsável: Jayme Garcia Arnal Barbedo

Principal investigator: Jayme Garcia Arnal Barbedo

Unidade/Instituição: Embrapa Agricultura Digital

Unit/Instituition: Embrapa Agricultura Digital

Data limite para inscrições: 08/05/2026

Deadline for submissions: 2026-05-08

Publicado em: 16/04/2026

Publishing date: 2026-04-16

Localização: Campinas

Locale: Campinas

E-mail para inscrições: jayme.barbedo@embrapa.br

E-mail for proposal submission: jayme.barbedo@embrapa.br

  • Atividades e contexto Activities and context

    O(A) bolsista atuará na geração, processamento e análise de dados de sequenciamento metabarcoding de DNA ambiental (eDNA) provenientes de amostras coletadas em áreas de Mata Atlântica no DAT (Distrito Agrotecnológico) Lagoinha (SP). As atividades incluem o processamento das amostras em laboratório, análise bioinformática, caracterização da diversidade biológica em diferentes paisagens e avaliação de variações sazonais na estrutura das comunidades.

    The fellow will work on the generation, processing, and analysis of environmental DNA (eDNA) metabarcoding sequencing data from samples collected in Atlantic Forest areas within the Lagoinha Agrotechnological District (DAT) in São Paulo state (Brazil). Activities include laboratory sample processing, bioinformatics analysis, characterization of biological diversity across different landscapes, and the assessment of seasonal variations in community structure.

  • Requisitos obrigatórios Mandatory requirements

    Doutorado em áreas afins (Ciências Ambientais, Ciências Agrárias, Ecologia, Biologia Molecular, Genética, Microbiologia, Química, Bioinformática ou correlatas). Experiência em Biologia Molecular e conhecimento em Bioinformática aplicada, incluindo uso de pipelines (ex.: QIIME2, DADA2 ou similares). Familiaridade com ambiente Linux/Unix e análise de dados em R e/ou Python. Capacidade de trabalhar de forma independente e em equipe interdisciplinar, incluindo o treinamento de outros bolsistas. Disponibilidade para atuação presencial. Doutorado concluído há menos de 7 (sete) anos.

    PhD in related fields (Environmental Sciences, Agricultural Sciences, Ecology, Molecular Biology, Genetics, Microbiology, Chemistry, Bioinformatics, or related areas). Experience in Molecular Biology and expertise in applied Bioinformatics, including the use of pipelines (e.g., QIIME2, DADA2, or similar). Familiarity with Linux/Unix environments and data analysis in R and/or Python. Ability to work independently and within interdisciplinary teams, including the training of other fellows/scholars. Availability for on-site work. PhD completed within the last 7 (seven) years.

  • Requisitos desejáveis Desirable requirements

    Experiência com biologia molecular aplicada a eDNA, metagenômica e estudos de biodiversidade (análises de diversidade α e β). Sequenciamento de próxima geração (NGS) e bancos de dados (SILVA, BOLD, UNITE, GenBank). Uso de Git. Redação científica em inglês. Atuação em projetos colaborativos.

    Experience in molecular biology applied to eDNA, metagenomics, and biodiversity studies (α and β diversity analyses). Proficiency in NGS (Next-Generation Sequencing) and taxonomic databases (SILVA, BOLD, UNITE, GenBank). Experience using Git for version control. Scientific writing skills in English. Proven ability to work in collaborative projects.

  • Como se candidatar How to apply

    CV (Lattes para candidatos brasileiros); certificado de Doutorado e carta de interesse. Inscrições exclusivamente para jayme.barbedo@embrapa.br, com o assunto “Bolsa-PD Biodiversidade e eDNA”.

    CV (Lattes CV for Brazilian candidates), PhD certificate and a Letter of Interest. Applications must be sent exclusively to jayme.barbedo@embrapa.br with the subject line “Bolsa-PD Biodiversidade e eDNA”.