Bolsa de PD em Ciências da Computação / Engenharia Biomédica

Post-Doctoral Fellowship in Computer Science / Biomedical Engineering

Nº: 4110

Área de conhecimento: Ciência da Computação

Field of knowledge: Computer science

Nº do processo FAPESP: 2019/07665-4

FAPESP process: 2019/07665-4

Título do projeto: Centro de Inteligência Artificial

Project title: Center for Artificial Intelligence

Área de atuação: Ciências da Computação, Engenharia de Computação, Engenharia Biomédica ou Física Computacional ou áreas correlatas

Working area: Computer Science, Computer Engineering, Biomedical Engineering, Computational Physics or correlated areas

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador principal: Fabio Gagliardi Cozman

Principal investigator: Fabio Gagliardi Cozman

Unidade/Instituição: Instituto do Coração (InCor) – HC FMUSP

Unit/Instituition: Instituto do Coração (InCor) – HC FMUSP

Data limite para inscrições: 02/03/2021

Deadline for submissions: 2021-03-02

Publicado em: 12/02/2021

Publishing date: 2021-02-12

Localização: Av. Dr. Enéas de Carvalho Aguiar, 44, São Paulo

Locale: Av. Dr. Enéas de Carvalho Aguiar, 44, São Paulo

E-mail para inscrições: j.krieger@hc.fm.usp.br

E-mail for proposal submission: j.krieger@hc.fm.usp.br

  • Resumo Summary

    Os candidatos devem possuir doutorado recente em Ciências da Computação, Engenharia de Computação, Engenharia Biomédica ou Física Computacional ou áreas correlatas, com experiência na construção de bases de dados de imagens médicas e biomarcadores baseados em métodos de aprendizagem profunda (Deep Learning) e radiômica.

    O pesquisador fará parte do Centro de Inteligência Artificial, um Centro de Pesquisa em Engenharia (CPE) apoiado pela FAPESP em parceria com a IBM, para atuar no InCor/HC-FMUSP.

    As responsabilidades são:

    1) Desenvolver modelagem teórica que permita organizar e correlacionar os dados de pacientes, visando destacar aspectos comuns e de separação entre casos;
    2) Aprimoramento da abordagem Radiômica;
    3) Desenvolver modelos preditivos, baseados em aprendizagem profunda, com os marcadores quantitativos;
    4) Avaliar e analisar os resultados obtidos pelos métodos propostos por meio de métricas objetivas, tais como sensibilidade, especificidade, área sob a curva ROC, F1-Score, acurácia e precisão.

    Os interessados devem ter disponibilidade para viajar e fluência em inglês.

    Os candidatos devem enviar e-mail para: Prof. Dr. José Eduardo Krieger no endereço marcelly.rosal@hc.fm.usp.br, com o assunto “Seleção para bolsa de pós-doutorado: Projeto FAPESP-IBM”, anexando os seguintes documentos:

    - Duas cartas de recomendação;
    - Currículo, contendo diplomas e publicações relevantes;
    - Uma breve declaração de interesse;
    - Histórico de pesquisa em bancos de dados de imagens médicas, métodos de aprendizado profundo e biomarcadores radiômicos.

    A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 7.373,10 mensais e Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    Candidates must hold a recent Ph.D. in Computer Science, Computer Engineering, Biomedical Engineering, Computational Physics or correlated areas, with experience in building medical image databases and biomarkers based on deep learning and radiomics.

    The selected candidate will join the Center for Artificial Intelligence (C4AI), an Engineering Research Center (ERC) supported by the São Paulo Research Foundation in partnership with IBM. Investigations will be conducted at the Heart Institute of Hospital das Clínicas (HC), the hospital complex run by the University of São Paulo's Medical School (FM-USP) in São Paulo, Brazil.

    Requirements

    Must hold a recent Ph.D. in Computer Science, Computer Engineering, Biomedical Engineering, Computational Physics or correlated areas, with experience in building medical image databases and biomarkers based on deep learning and radiomics.

    Expected responsibilities:

    1) To develop theoretical modeling that allows organizing and correlating the data of patients, aiming to highlight common aspects and separation between cases;
    2) The improvement of the radiomic approach;
    3) To develop predictive models, based on deep learning, with the quantitative markers;
    4) To evaluate and analyze the results obtained by the proposed methods by means of objective metrics, such as sensitivity, specificity, area under the ROC curve, F1-Score, accuracy and precision.

    Applicants should send a message to: Prof. Dr. José Eduardo Krieger (marcelly.rosal@hc.fm.usp.br) with the subject "Selection for postdoctoral fellowship: FAPESP-IBM Project" attaching the following documents:

    - Two letters of recommendation;
    - A short CV containing degrees, relevant publications; and
    - A short statement of research interest and background for developing novel research.

    This opportunity is open to candidates of any nationalities. The selected candidate will receive a FAPESP’s Post-Doctoral fellowship in the amount of R$ 7,373.10 monthly and a research contingency fund, equivalent to 10% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.