Bolsa de TT-V em Bioinformática de Microbioma de Planta

Level 5-Technical Training Fellowship in Plant Microbiome Bioinformatics

Nº: 4188

Área de conhecimento: Genética

Field of knowledge: Genetics

Nº do processo FAPESP: 2016/23218-0

FAPESP process: 2016/23218-0

Título do projeto: Centro de Pesquisa em Genômica Aplicada às Mudanças Climáticas

Project title: Genomics for Climate Change Research Center (GCCRC)

Área de atuação: Bioinformática de Microbioma de Planta

Working area: Plant Microbiome Bioinformatics

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador principal: Paulo Arruda

Principal investigator: Paulo Arruda

Unidade/Instituição: CBMEG/Unicamp

Unit/Instituition: CBMEG/Unicamp

Data limite para inscrições: 23/04/2021

Deadline for submissions: 2021-04-23

Publicado em: 19/03/2021

Publishing date: 2021-03-19

Localização: Avenida Cândido Rondon, 400, Cidade Universitária, Campinas

Locale: Avenida Cândido Rondon, 400, Cidade Universitária, Campinas

E-mail para inscrições: gccrc@gmail.com

E-mail for proposal submission: gccrc@gmail.com

  • Resumo

    O Centro de Pesquisa em Genômica para Mudanças Climáticas (GCCRC) desenvolve tecnologias para aumentar a tolerância das plantas aos estresses impostos pelas mudanças climáticas globais. Buscamos um(a) bioinformata experiente e criativo(a) na área de microbioma de plantas para desenvolver pipelines de bioinformática na investigação de genomas, metagenomas e metatranscriptomas e, assim, desvendar novos mecanismos relacionados à interação planta–microrganismo em ambientes naturais submetidos a condições hídricas e nutricionais estressantes. 

    Qualificações desejáveis

    • Graduado ou pós-graduado, com pelo menos 5 anos de experiência sólida em programação e análise de dados de bioinformática;

    • Prática em análise de dados gerados em plataformas de sequenciamento de larga escala (Illumina, Nanopore, Pacbio, etc.);

    • Experiência na análise de dados de microbioma, como sequenciamento 16S/ITS, montagem e anotação de genomas, metagenomas ou (meta)-transcriptomas, etc.;

    • Desejável experiência com computação de alto desempenho, aprendizado de máquina, visualização de dados e gerenciamento de big data;

    • Grande capacidade de organização, habilidades de comunicação e comunicação em inglês.

    Para aplicar a vaga, o(a) candidato(a) deve enviar carta de apresentação, CV e carta de recomendação em https://www.gccrc.unicamp.br/gccrc-jobs/ para a posição “Bioinformatics Microbiome”

    Mais detalhes sobre perfil e condições da Bolsa FAPESP TT-V em https://fapesp.br/3098 e https://fapesp/3162.