Bolsa de PD em Biologia Estrutural

Post-Doctoral Fellowship in Structural Biology

Nº: 4090

Área de conhecimento: Bioquímica

Field of knowledge: Biochemistry

Nº do processo FAPESP: 2017/17303-7

FAPESP process: 2017/17303-7

Título do projeto: Estrutura e Função de Sistemas de Secreção Bacterianas

Project title: Structure and Function of Bacterial Secretion Systems

Área de atuação: Biologia Estrutural

Working area: Structural Biology

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Início: 08/03/2021

Start: 2021-03-08

Pesquisador principal: Shaker Chuck Farah

Principal investigator: Shaker Chuck Farah

Unidade/Instituição: Instituto de Química/USP

Unit/Instituition: Instituto de Química/USP

Data limite para inscrições: 01/03/2021

Deadline for submissions: 2021-03-01

Publicado em: 08/02/2021

Publishing date: 2021-02-08

Localização: Av. Prof. Lineu Prestes, 748, São Paulo

Locale: Av. Prof. Lineu Prestes, 748, São Paulo

E-mail para inscrições: roberto@iq.usp.br

E-mail for proposal submission: roberto@iq.usp.br

  • Resumo Summary

    Oportunidade de Bolsa FAPESP de Pós-Doutorado para trabalhar no Projeto Temático “Estrutura e Função de Sistemas de Secreção Bacterianas”. O Sistema de Secreção do Tipo IV (T4SS) da bactéria Gram negativa Xanthomonas citri é um complexo supramolecular (> 3 MDa) que seleciona, transporta, e insere toxinas em outras bactérias, para assim provocar a morte celular. Estudos de microscopia crio-eletrônica (Cryo-EM) realizados em nosso laboratório permitiram a reconstrução da estrutura tridimensional do subconjunto de proteínas associadas com a membrana externa "core complex" do T4SS de X. citri.

    O candidato selecionado deverá utilizar Ressonância Magnética Nuclear (RMN), Cryo-EM, e/ou simulações de dinâmica molecular para investigar a estrutura e o mecanismo de funcionamento deste complexo. Candidatos com perfil adequado deverão ter formação em biologia, química, física, ou áreas afins, e doutorado na área de biofísica ou biologia estrutural. Candidatos que, além disso, tenham experiência em Cryo-EM, RMN, ou dinâmica molecular, bem como fluência em Linux e programação (Python, Matlab) serão bem vindos.

    Documentação: os interessados deverão escrever para Shaker C. Farah (chsfarah@iq.usp.br) ou Roberto K. Salinas (roberto@iq.usp.br) e enviar os seguintes documentos: i) uma carta de apresentação; ii) curriculum resumido; iii) uma carta de recomendação.

    A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 7.373,10 mensais e Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    Opportunity for a post-doctoral fellowship to work on the project “Structure and Function of Bacterial Secretion Systems”. Type IV Secretion Systems (T4SSs) are supramolecular complexes (> 3 MDa) that select and translocate proteins or protein-DNA complexes across the cellular envelope of Gram-negative bacteria. The T4SS of Xanthomonas citri, a phytopathogen that infects and causes disease in citrus plants, is specialized in the secretion of toxins that kill other Gram-negative bacteria. Cryo-electron microscopy (Cryo-EM) studies carried out in our group allowed the reconstruction of the three-dimensional structure of a X. citri T4SS sub-complex associated with the external membrane.

    The selected candidate will use Nuclear Magnetic Resonance (NMR), Cryo-EM, or molecular dynamics simulations to investigate the structure of this complex and the mechanism of substrate translocation. Suitable candidates should have a background in biology, chemistry, physics or related areas, and a PhD in structural biology or biophysics. Preference will be given to candidates that have previous experience on Cryo-EM, NMR, or molecular simulations, as well as fluency in Linux, Matlab or python programming.

    Documents: Interested candidates should write to Shaker C. Farah (chsfarah@iq.usp.br) or Roberto K. Salinas (roberto@iq.usp.br) and send a letter of intention, a brief CV, and a recommendation letter.

    This opportunity is open to candidates of any nationalities. The selected candidate will receive a Post-Doctoral fellowship from the São Paulo Research Foundation (FAPESP) in the amount of R$ 7,373.10 monthly and a research contingency fund, equivalent to 10% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.