Bolsa de PD em Biologia Estrutural

Post-Doctoral Fellowship in Structural Biology

Nº: 6494

Área de conhecimento: Bioquímica

Field of knowledge: Biochemistry

Nº do processo FAPESP: 2020/08615-8

FAPESP process: 2020/08615-8

Título do projeto: Exosítios de proteínas, sítios crípticos e moonlighting: identificação, mapeamento funcional e efeitos de alteração estrutural

Project title: Protein exosites, cryptic sites and moonlighting: identification, functional mapping and effects of changes in structure

Área de atuação: Bioquímica, Biologia Molecular, Biologia Estrutural

Working area: Biochemistry, Molecular Biology, Structural Biology

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Início: 01/03/2024

Start: 2024-03-01

Pesquisador responsável: Raghuvir K. Arni

Principal investigator: Raghuvir K. Arni

Unidade/Instituição: Ibilce-Unesp

Unit/Instituition: Ibilce-Unesp

Data limite para inscrições: 31/12/2023

Deadline for submissions: 2023-12-31

Publicado em: 27/10/2023

Publishing date: 2023-10-27

Localização: Rua Cristovão Colombo, 2265, São José do Rio Preto

Locale: Rua Cristovão Colombo, 2265, São José do Rio Preto

E-mail para inscrições: raghuvir.arni@unesp.br

E-mail for proposal submission: raghuvir.arni@unesp.br

  • Resumo Summary

    Uma bolsa de pós-doutorado está disponível no grupo de pesquisa da Profª Paula Rahal, no Laboratório de Estudos Gênomicos do Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas da Universidade Estadual de São Paulo (Ibilce-Unesp) em São José do Rio Preto.

    Objetivo da pesquisa: proteínas de microrganismos patogênicos serão expressas, purificadas e complexadas com peptídeos de ligação aos exosítios identificados por Phage Display. A co-cristalização proteína-peptídeo e posterior difração de raios-X serão realizados para obtenção de detalhes estereoquímicos de interação proteína-ligante. As proteínas também serão utilizadas para estudos metabolômicos.

    A pesquisa se insere no âmbito de Projeto Temático FAPESP (processo nº 2020/08615-8) coordenado pelo Professor Raghuvir K. Arni.

    Candidatura – atribuições:

    1) Síntese de vetores de expressão de proteínas para o uso em sistemas procariotos e eucariotos;

    2) Expressão em larga escala, purificação por cromatografia de afinidade, exclusão molecular e troca iônica das proteínas recombinantes;

    3) Imobilização de proteínas e aplicação de biopanning usando bibliotecas Phage Display;

    4) Síntese de peptídeos selecionados por Phage Display e testes experimentais de solubilidade, afinidade e interação.

    Qualificações desejadas: Doutorado em Biofísica, Biologia Molecular ou Microbiologia. Sólida formação em biologia molecular, expressão, purificação e caracterização de proteínas. É desejado experiência com técnicas espectroscópicas, Phage Display e/ou cristalografia de proteínas.

    A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 9.047,40 mensais e Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    A post-doctoral fellowship is available initially for a period of 24 months in the research group of Prof. Paula Rahal at the Laboratory of Genomic Studies of the São Paulo State University's Institute of Biosciences, Letters and Exact Sciences (IBILCE-UNESP) in São José do Rio Preto, Brazil.

    Research objective: The target proteins will be expressed purified and complexed with the exosite binding peptides as identified by Phage Display, will be co-crystallized and their structures will be determined by using X-ray diffraction techniques to obtain the stereochemical details to help elucidate the protein-ligand-exosite interactions. The proteins will also be used for metabolomics studies.

    This research is under the aegis of a Thematic Project funded by FAPESP, the São Paulo Research Foundation (grant number 2020/08615-8), and coordinated by Prof. Raghuvir K. Arni. 

    Necessary attributes to fill the position:

    1) Synthesis of expression vectors for use in prokaryotic or eukaryotic systems.

    2) Large-scale expression; purification by affinity, size-exclusion and ion exchange chromatography.

    3) Protein immobilization and application of biopanning cycles using Phage Display libraries.

    4) Synthesis of peptides selected by Phage Display and experimental solubility, affinity and interaction analysis.

    Desired Qualifications: PhD in Biophysics, Molecular Biology or Microbiology. Solid background in molecular biology, protein expression, purification and characterization. Experience with spectroscopic techniques or Phage Display or X-ray crystallography is desirable.

    This opportunity is open to candidates of any nationality. The selected candidate will receive a Post-Doctoral fellowship from the São Paulo Research Foundation (FAPESP) in the amount of R$ 9,047.40 monthly and a research contingency fund, equivalent to 10% of the annual value of the fellowship which should be spent on items directly related to the research activity.