Bolsa de PD em Biofísica / Cristalografia

Post-Doctoral Fellowship in Biophysics / Crystallography

• Resumo Summary

  Esta é uma de duas bolsas de pós-doutorado disponíveis para ingressar no grupo de pesquisa do Prof. R. K. Arni, no Centro Multiusuário de Inovação Biomolecular (UNESP, câmpus São José do Rio Preto), e desenvolver pesquisa como parte do Projeto Temático “Exosítios de proteínas, sítios crípticos e moonlighting: identificação, mapeamento funcional e efeitos de alteração estrutural”.

  Objetivo da pesquisa: proteínas de microrganismos patogênicos serão expressas, purificadas e complexadas com peptídeos de ligação aos exosítios identificados por Phage Display. Co-cristalização proteína-peptídeo e, posteriormente, difração de raios-X, serão realizadas para obtenção de detalhes estereoquímicos de interação proteína-ligante. As proteínas também serão utilizadas para estudos metabolômicos.

  Atribuições:

  1) Atuar em conjunto com o pós-doutorando selecionado na segunda vaga do Projeto Temático para o estabelecimento de protocolos eficientes de expressão em larga escala de proteínas recombinantes e purificação para ensaios de cristalização e co-cristalização;

  2) Realizar ensaios de cristalização e co-cristalização de proteínas e complexos proteína-peptídeo, respectivamente;

  3) Conduzir a coleta de dados de difração de raios-X na fonte de origem ou na linha de luz de MANACA (SIRIUS, Campinas);

  4) Processamento de dados, determinação e refinamento das estruturas tridimensionas de proteínas.

  Qualificações desejadas: Doutorado em Biofísica ou áreas afins. Experiência em cristalização de proteínas, coleta de dados e determinação estrutural. É desejado conhecimento em bioquímica, enzimologia, simulações de dinâmica molecular e/ou planejamento de fármacos por técnicas computacionais.

  Enviar Currículo Lattes, carta de apresentação/motivação, comprovante de título de doutor e duas cartas de referência para o e-mail raghuvir.arni@unesp.br. 

  A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 8.479,20 mensais e Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

  This is one of two post-doctoral fellowships available to join the research group of Prof. R. K. Arni at the Multiuser Center for Biomolecular Innovation of the São Paulo State University (UNESP) in São José do Rio Preto, Brazil, developing research as part of the Thematic Project titled “Protein exosites, cryptic sites and moonlighting: Identification, functional mapping and effects of structural change”.

  Research Objective: The target proteins will be expressed purified and complexed with the exosite binding peptides as identified by Phage Display and will be co-crystallized and their structures will be determined by using X-ray diffraction techniques to obtain the stereochemical details to help elucidate the protein-ligand interactions. The proteins will also be used for metabolomics studies.

  Attributions:

  1) Work along with the second post-doctoral scientist selected for the project to establish efficient protocols for the large-scale expression of recombinant proteins and to obtain high-purity samples for crystallization trials;

  2) Crystallization of proteins and protein+peptide complexes;

  3) Conduct X-ray diffraction data collection either at the home source or at the Manaca beamline (LNLS, the Brazilian Synchrotron Light Laboratory in Campinas, São Paulo state);

  4) Data processing, structure determination and refinement.

  Desired Qualifications: PhD in Biophysics or related areas. Experience in protein crystallization, data collection and structure determination. Knowledge of biochemistry or molecular dynamics simulations or computer-aided drug discovery or enzymatic assays is desirable.
   
  Send CV, cover letter/motivation, proof of PhD title and 2 reference letters/names to raghuvir.arni@unesp.br. 

  This opportunity is open to candidates of any nationality. The selected candidate will receive a Post-Doctoral fellowship from the São Paulo Research Foundation (FAPESP) in the amount of R$ 8,479.20 monthly and a research contingency fund, equivalent to 10% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity.