Bolsa de PD em Biologia Molecular

Post-Doctoral Fellowship in Molecular Biology

Nº: 5289

Área de conhecimento: Bioquímica

Field of knowledge: Biochemistry

Nº do processo FAPESP: 2020/08615-8

FAPESP process: 2020/08615-8

Título do projeto: Exosítios de proteínas, sítios crípticos e moonlighting: identificação, mapeamento funcional e efeitos de alteração estrutural

Project title: Protein exosites, cryptic sites and moonlighting: Identification, functional mapping and effects of structural change

Área de atuação: Biologia Molecular

Working area: Molecular Biology

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador responsável: Raghuvir K Arni

Principal investigator: Raghuvir K Arni

Unidade/Instituição: IBILCE-Unesp

Unit/Instituition: IBILCE-Unesp

Data limite para inscrições: 15/08/2022

Deadline for submissions: 2022-08-15

Publicado em: 18/07/2022

Publishing date: 2022-07-18

Localização: Rua Cristóvão Colombo, 2265, São José do Rio Preto

Locale: Rua Cristóvão Colombo, 2265, São José do Rio Preto

E-mail para inscrições: raghuvir.arni@unesp.br

E-mail for proposal submission: raghuvir.arni@unesp.br

  • Resumo Summary

    Esta é uma de duas bolsas de pós-doutorado disponíveis para ingressar no grupo de pesquisa do Prof. R. K. Arni, no Centro Multiusuário de Inovação Biomolecular (UNESP, câmpus São José do Rio Preto), e desenvolver pesquisa como parte do Projeto Temático “Exosítios de proteínas, sítios crípticos e moonlighting: identificação, mapeamento funcional e efeitos de alteração estrutural”.

    Objetivo da pesquisa: proteínas de microrganismos patogênicos serão expressas, purificadas e complexadas com peptídeos de ligação aos exosítios identificados por Phage Display. Co-cristalização proteína-peptídeo e, posteriormente, difração de raios-X, serão realizados para obtenção de detalhes estereoquímicos de interação proteína-ligante. As proteínas também serão utilizadas para estudos metabolômicos.

    Atribuições:

    1) Síntese de vetores de expressão de proteínas para o uso em sistemas procariotos e eucariotos;

    2) Expressão em larga escala; purificação por cromatografia de afinidade, exclusão molecular e troca iônica das proteínas recombinantes;

    3) Imobilização de proteínas e aplicação biopanning usando bibliotecas Phage Display;

    4) Síntese de peptídeos selecionados por Phage Display e testes experimentais de solubilidade, afinidade e interação;

    5) Caracterização biofísica/bioquímica e avaliação das internações entre biomoléculas (proteínas e péptidos) por meio de de técnicas calorimétricas e espectroscópicas;

    6) Condução de metagêneses sítio-dirigidas em vetores de expressão.

    Qualificações desejadas: Doutorado em Biofísica, Biologia Molecular, Bioquímica, Microbiologia ou áreas afins. Sólida formação em biologia molecular, expressão, purificação e caracterização de proteínas. É desejado experiência com técnicas espectroscópicas, phage display e/ou cristalização de proteínas.

    Enviar Currículo Lattes, carta de apresentação/motivação, comprovante de título de doutor e duas cartas de referência para o e-mail raghuvir.arni@unesp.br.

    A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 8.479,20 mensais e Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    This is one of two post-doctoral fellowships available to join the research group of Prof. R. K. Arni at the Multiuser Center for Biomolecular Innovation of the São Paulo State University (UNESP) in São José do Rio Preto, Brazil, developing research as part of the Thematic Project titled “Protein exosites, cryptic sites and moonlighting: Identification, functional mapping and effects of structural change”.

    Research Objective: The target proteins will be expressed purified and complexed with the exosite binding peptides as identified by Phage Display and will be co-crystallized and their structures will be determined by using X-ray diffraction techniques to obtain the stereochemical details to help elucidate the protein-ligand interactions. The proteins will also be used for metabolomics studies.

    Attributions:

    1) Synthesis of expression vectors for use in prokaryotic or eukaryotic systems;

    2) Expression in large scale; purification by affinity, size-exclusion, and ion exchange chromatography;

    3) Protein immobilization and application of biopanning cycles using Phage Display libraries;

    4) Synthesis of peptides selected by Phage Display and experimental tests of solubility, affinity and interaction;

    5) Biophysical/biochemical characterization and evaluation of interactions between biomolecules (proteins and peptides) by applying calorimetric and spectroscopic techniques;

    6) Conduction of site-directed mutagenesis in expression vectors.

    Desired Qualifications: PhD in Biophysics, Molecular Biology, Biochemistry or Microbiology or related areas. Solid background in molecular biology, protein expression, purification and characterization. Experience with spectroscopic techniques or phage display or crystallization is desirable.

    Send CV, cover letter/motivation, proof of PhD title and 2 reference letters/names to raghuvir.arni@unesp.br.

    This opportunity is open to candidates of any nationality. The selected candidate will receive a Post-Doctoral fellowship from the São Paulo Research Foundation (FAPESP) in the amount of R$ 8,479.20 monthly and a research contingency fund, equivalent to 10% of the annual value of the fellowship which should be spent in items directly related to the research activity. 
     
    More information about the fellowship is at: [link nossa página]