Bolsa de PD em Genética e Bioinformática

Post-Doctoral Fellowship in Genetics and Bioinformatics

Nº: 7975

Área de conhecimento: Genética

Field of knowledge: Genetics

Nº do processo FAPESP: 2021/14851-9

FAPESP process: 2021/14851-9

Título do projeto: Genômica Populacional Humana: uma perspectiva a partir de populações miscigenadas

Project title: Human Population Genomics: A perspective from mixed populations

Área de atuação: Genética e Bioinformática

Working area: Genetics and Bioinformatics

Quantidade de vagas: 1

Positions: 1

Início: 01/06/2025

Start: 2025-06-01

Pesquisador responsável: Erick Castelli

Principal investigator: Erick Castelli

Unidade/Instituição: Faculdade de Medicina de Botucatu, Universidade Estadual Paulista (FMB-Unesp)

Unit/Instituition: Faculdade de Medicina de Botucatu, Universidade Estadual Paulista (FMB-Unesp)

Data limite para inscrições: 30/04/2025

Deadline for submissions: 2025-04-30

Publicado em: 12/03/2025

Publishing date: 2025-03-12

Localização: Av. Prof. Mario Rubens Guimarães Montenegro, s/n, Botucatu

Locale: Av. Prof. Mario Rubens Guimarães Montenegro, s/n, Botucatu

E-mail para inscrições: erick.castelli@unesp.br

E-mail for proposal submission: erick.castelli@unesp.br

  • Resumo Summary

    Vaga de pós-doutorado para brasileiro(a) ou estrangeiro(a) para trabalhar em projeto de pesquisa visando:

    a) Desenvolvimento de pipelines e ferramentas computacionais para análise de genes muito polimórficos e relacionados com o sistema imunológico, incluindo a região do Complexo Principal de Histocompatibilidade – MHC humano (genes HLA e outros) e do Complexo de Receptores Leucocitários – LRC (incluindo genes KIR), a partir de dados de sequenciamento de genomas completos (Illumina, Nanopore e PacBio), de exomas (Illumina) e de sequenciamento de mRNA/cDNA (Illumina e Nanopore);

    b) Caracterização da diversidade genética no MHC e LRC em amostras de diferentes países;

    c) Caracterização do perfil transcricional dos genes do MHC e LRC humano em amostras de diferentes tecidos.

    O grupo GeMBio possui larga experiência em desenvolvimento de ferramentas computacionais para análise desses genes (vide: https://github.com/erickcastelli/hla-mapper e https://github.com/erickcastelli/kir-mapper).

    O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 12.000,00 mensais e Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

     

     

    Post-doctoral position for candidates of any nationality to work at the São Paulo State University's Botucatu Medical School (FMB-UNESP) in Brazil on an ongoing research project aiming at:

    a) Development of pipelines and computational tools for the analysis of highly polymorphic genes related to the immune system, including the human Major Histocompatibility Complex – MHC region (HLA genes and others) and the Leukocyte Receptors Complex – LRC (including KIR genes), from whole genome sequencing data (Illumina, Nanopore and PacBio), exome sequencing (Illumina) and mRNA/cDNA sequencing (Illumina and Nanopore);

    b) Characterization of genetic diversity in the MHC and LRC in samples from different countries;

    c) Characterization of the transcriptional profile of human MHC and LRC genes in samples from different tissues.

    The GeMBio group has extensive experience in developing computational tools for analyzing these genes (see https://github.com/erickcastelli/hla-mapper and https://github.com/erickcastelli/kir-mapper).

    The selected candidate will receive a Post-Doctoral fellowship from the São Paulo Research Foundation (FAPESP) in the amount of R$ 12,000.00 monthly and a research contingency fund, equivalent to 10% of the annual value of the fellowship which should be spent on items directly related to the research activity. 

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