Bolsa de PD em Genômica / Bioinformática

)Post-Doctoral Fellowship in Genomics / Bioinformatics

• Atividades e contexto Activities and context

  O bolsista atuará no projeto de pangenômica do bacuri (Platonia insignis), analisando a evolução de retrotransposons LTR, elementos transponíveis, duplicações gênicas e famílias associadas ao desenvolvimento de frutos. Também investigará sinais de seleção positiva, possíveis processos de neo e subfuncionalização, e motivos regulatórios em regiões promotoras, integrando esses dados ao genoma de referência e ao pangenoma da espécie para compreender sua diversidade genômico-funcional. A bolsa terá duração inicial de 1 ano, podendo ser renovada por igual período.

  The selected post-doctoral will work on the bacuri (Platonia insignis) pangenomics project, analyzing the evolution of LTR retrotransposons, transposable elements, gene duplications, and gene families associated with fruit development. The fellow will also investigate signatures of positive selection, potential neo- and subfunctionalization processes, and regulatory motifs in promoter regions, integrating these data with the reference genome and pangenome to understand the species’ genomic-functional diversity. The fellowship will have an initial duration of 1 year.

• Requisitos obrigatórios Mandatory requirements

  Requisitos: doutorado concluído em Genética, Genômica, Bioinformática, Biologia Molecular, Biotecnologia, Ciências Biológicas, Agronomia ou áreas correlatas; experiência em bioinformática aplicada a genomas, transcriptomas ou genômica comparativa; domínio de Linux, linha de comando e pipelines; experiência em algumas áreas como montagem/anotação genômica, elementos transponíveis, LTRs, duplicações gênicas, filogenômica, evolução molecular, seleção positiva ou famílias gênicas; capacidade de documentar análises e redigir artigos em inglês.

  Completed PhD in Genetics, Genomics, Bioinformatics, Molecular Biology, Biotechnology, Biological Sciences, Agronomy, or related fields; experience in bioinformatics applied to genome, transcriptome, or comparative genomics analyses; proficiency in Linux, command-line tools, and pipelines; experience in areas such as genome assembly/annotation, transposable elements, LTRs, gene duplication, phylogenomics, molecular evolution, positive selection, or gene families; ability to document analyses and write manuscripts in English.

• Requisitos desejáveis Desirable requirements

  Conhecimentos em linguagens como R, Python, Perl, Bash ou similares serão considerados diferenciais. Também serão valorizadas experiências prévias com genomas vegetais de grande porte, dados PacBio HiFi, ONT ultralong, Hi-C, pangenômica ou evolução de genomas de plantas. Espera-se que o candidato demonstre capacidade de trabalhar em equipe, independência científica, organização, pró-atividade, responsabilidade na condução das análises, boa comunicação oral e escrita, proficiência em inglês científico e disposição para atuar em um ambiente colaborativo e multidisciplinar.

  Knowledge of programming languages such as R, Python, Perl, Bash, or similar will be considered an advantage. Previous experience with large plant genomes, PacBio HiFi data, ONT ultralong reads, Hi-C, pangenomics, or plant genome evolution will also be valued. The candidate is expected to demonstrate teamwork skills, scientific independence, organization, proactivity, responsibility in conducting analyses, good oral and written communication, proficiency in scientific English, and willingness to work in a collaborative and multidisciplinary environment.

• Como se candidatar How to apply

  As inscrições devem ser enviadas para alessandro.varani@unesp.br, com o assunto “Pós-doutorado Bacuri”. Documentos exigidos: Currículo Lattes e Súmula Curricular, para brasileiros, ou CV, para estrangeiros; cópia do diploma ou certificado de doutorado; carta de apresentação justificando o interesse e a aderência ao projeto, em PDF, com até 1 página; uma carta de recomendação, em PDF, com até 1 página; quando pertinente, links para repositórios de códigos, pipelines. Informações em: https://plantgenomics.ncc.unesp.br/opportunities/vaga_posdoc_bacuri_ptbr.html.

  Applications must be sent to alessandro.varani@unesp.br with the subject line “Postdoctoral Fellowship Bacuri”. Required documents: Lattes CV and Curricular Summary for Brazilian applicants, or CV for international applicants; copy of PhD diploma/certificate; one-page PDF cover letter explaining interest and fit with the project; one-page PDF recommendation letter; list of publications and, when relevant, links to code repositories, pipelines, analyses, or previous projects. Further information at: https://plantgenomics.ncc.unesp.br/opportunities/postdoc_bacuri_en.html.