Bolsa de PD em Biologia Molecular

Post-Doctoral Fellowship in Molecular Biology

Nº: 6293

Área de conhecimento: Microbiologia

Field of knowledge: Microbiology

Nº do processo FAPESP: 2021/10577-0

FAPESP process: 2021/10577-0

Título do projeto: Endolisinas de fagos (ELs) como agentes antimicrobianos para bactérias Gram-negativas

Project title: Phage endolysins (ELs) as antimicrobial agents to Gram-negative bacteria

Área de atuação: Biologia Molecular – Endolisinas de Fagos

Working area: Molecular Biology – Phage Endolysins

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Início: 01/10/2023

Start: 2023-10-01

Pesquisador responsável: Shaker Chuck Farah

Principal investigator: Shaker Chuck Farah

Unidade/Instituição: Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas (IB-Unicamp)

Unit/Instituition: Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas (IB-Unicamp)

Data limite para inscrições: 30/08/2023

Deadline for submissions: 2023-08-30

Publicado em: 10/08/2023

Publishing date: 2023-08-10

Localização: Rua Monteiro Lobato, 255, Campinas

Locale: Rua Monteiro Lobato, 255, Campinas

E-mail para inscrições: cepid-b3@iq.usp.br

E-mail for proposal submission: cepid-b3@iq.usp.br

  • Resumo Summary

    Uma bolsa de pós-doutorado está disponível no Laboratório de Biologia Molecular Bacteriana (LABMB) dentro do CEPID B3 (Biologia de Bactérias e Bacteriófagos) – um Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão apoiado pela FAPESP com sede no Instituto de Química da USP e que conta com diversas instituições associadas, entre elas o Instituto de Biologia da Unicamp.

    O objetivo é explorar o potencial uso de endolisinas de fagos (ELs) nativas e recombinantes como agentes antimicrobianos em bactérias Gram-negativas. Isso será realizado através de: seleção de sequências de endolisinas do GenBank com base na atividade catalítica e potenciais domínios de permeabilização da membrana externa; desenho in silico de endolisinas recombinantes; clonagem, expressão e purificação de endolisinas nativas e recombinantes; avaliação da atividade antimicrobiana in vitro; integridade celular bacteriana após tratamento com endolisinas observada por microscopia fluorescente e vazamento de ATP; teste da atividade antibacteriana em modelo de Galleria mellonella.

    É desejável que os candidatos tenham experiência em técnicas básicas de microbiologia e biologia molecular, tais como cultura bacteriana, PCR e clonagem, expressão e purificação de proteínas.

    As candidaturas devem ser enviadas para cepid-b3@iq.usp.br, até 30 de agosto de 2023, com os seguintes documentos:

    - Uma carta descrevendo os motivos de interesse pela posição e resumindo sua experiência académica anterior;
    - Duas cartas de recomendação;
    - Um breve CV indicando a links de Google Scholar, Research ID ou ORCID.

    A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 9.047,40 mensais e Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    A post-doctoral position is available in the Laboratory of Bacterial Molecular Biology (LABMB) within the CEPID B3 (Biology of Bacteria and Bacteriophages), one of the Research, Innovation and Dissemination Centers (CEPID in the Portuguese acronym) supported by FAPESP, the São Paulo Research Foundation, in São Paulo state, Brazil. CEPID B3 is hosted by the University of São Paulo's Institute of Chemistry (IQ-USP) and has several associated institute, the State University of Campinas's Institute of Biology (IB-UNICAMP) being one of them.

    The aim is to explore the potential use of native and recombinant phage endolysins (Els) as antimicrobial agents to Gram-negative bacteria. This will be accomplished by: selecting of endolysin sequences from GenBank based on catalytic activity and potential outer membrane permeabilization domains; in silico design of recombinant endolysins; cloning, expression and purification of native and recombinant endolysins; evaluation of antimicrobial activity in vitro with free or encapsulated formulations; bacterial cell integrity after endolysin treatment observed by fluorescent microscopy and ATP leakage; test of the antibacterial activity in Galleria mellonella model.

    It is desirable that candidates have experience in basic microbiology and molecular biology techniques, such as bacterial growing, PCR and cloning, protein expression and purification.

    Applications must be submitted via e-mail to cepid-b3@iq.usp.br by August 30th, 2023, accompanied by the following documents:

    - A letter describing the reasons for the interest in this position and previous academic experience;
    - Two recommendation letters;
    - A short CV indicating the link to Google Scholar, Research ID or ORCID profiles.

    This opportunity is open to candidates of any nationality. The selected candidate will receive a FAPESP Post-Doctoral fellowship in the amount of R$ 9,047.40 monthly and a research contingency fund, equivalent to 10% of the annual value of the fellowship which should be spent on items directly related to the research activity.