Bolsas de PD em Criomicroscopia Eletrônica

Post-Doctoral Fellowships in Cryogenic Electron Microscopy

Nº: 6567

Área de conhecimento: Interdisciplinar

Field of knowledge: interdisciplinary

Nº do processo FAPESP: 2020/06062-1

FAPESP process: 2020/06062-1

Título do projeto: Complexos biológicos em ação, in vitro e in silico (Explorando Big-Data em criomicroscopia eletrônica)

Project title: Biological complexes in action, in vitro and in silico (Exploiting Big-Data in Cryo-EM)

Área de atuação: Criomicroscopia Eletrônica

Working area: Cryogenic Electron Microscopy

Quantidade de vagas: 2

Number of places: 2

Pesquisador responsável: Marin van Heel

Principal investigator: Marin van Heel

Unidade/Instituição: Laboratório Nacional de Nanotecnologia (LNNano/CNPEM)

Unit/Instituition: Laboratório Nacional de Nanotecnologia (LNNano/CNPEM)

Data limite para inscrições: 04/02/2024

Deadline for submissions: 2024-02-04

Publicado em: 24/11/2023

Publishing date: 2023-11-24

Localização: Rua Giuseppe Máximo Scolfaro, 10000, Campinas

Locale: Rua Giuseppe Máximo Scolfaro, 10000, Campinas

E-mail para inscrições: rodrigo.portugal@lnnano.cnpem.br

E-mail for proposal submission: rodrigo.portugal@lnnano.cnpem.br

  • Resumo Summary

    O Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM) oferece duas Bolsas de Pós-Doutoramento (PD) para atuar no desenvolvimento de novos métodos na área de criomicroscopia eletrônica (CryoEM). O Projeto será realizado no Laboratório de Criomicroscopia Eletrônica do LNNano/CNPEM.

    Uma posição de pós-doutorado é dedicada ao desenvolvimento de métodos para otimizar o processamento de dados em nosso pipeline de análise de dados de CryoEM. O foco está no processamento eficiente de grandes conjuntos de dados, visando principalmente o processamento 4D, relacionado à variabilidade estrutural de proteínas, em escala global e local.

    Outra posição de pós-doutorado é dedicada ao desenvolvimento de dispositivos e métodos na área de criomicroscopia eletrônica resolvida no tempo (Time-Resolved CryoEM). Essa técnica visa o estudo de complexos macromoleculares em estados fora do equilíbrio, através do congelamento rápido de reações entre macromoléculas biológicas.

    Os candidatos selecionados também serão responsáveis pelo uso dessas novas metodologias para apoiar nossos esforços em diferentes projetos de biologia estrutural. O CNPEM está equipado com microscópios para CryoEM de última geração, permitindo a obtenção de estruturas de resolução atômica de complexos biológicos.

    Mais detalhes em: https://lnnano.cnpem.br/oportunidade-de-bolsas-fapesp-de-pos-doutorado-para-atuacao-no-lnnano-cnpem/.

    As vagas estão abertas a brasileiros e estrangeiros. Cada selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 9.047,40 mensais e Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    The Brazilian Center for Research in Energy and Materials (CNPEM) in Campinas, São Paulo state, offers two Post-Doctoral Fellowships to work on the development of new methods in cryogenic electron microscopy (CryoEM). The Project will be carried out at the Cryo-EM group at the Brazilian Nanotechnology National Laboratory (LNNano/CNPEM).

    A post-doctoral position is dedicated to developing methods to optimize data processing in our CryoEM data analysis pipeline. The focus is on the efficient processing of large data sets, mainly aiming at 4D processing, related to the structural variability of proteins, on a global and local scale.

    Another post-doctoral position is dedicated to the development of devices and methods in the area of Time-Resolved CryoEM. This technique aims to study macromolecular complexes in non-equilibrium states, through the rapid freezing of reactions between biological macromolecules.

    Selected candidates will also be responsible for using these new methodologies to support our efforts in different structural biology projects. CNPEM is equipped with state-of-the-art CryoEM microscopes, allowing atomic resolution structures of biological complexes to be obtained.

    This opportunity is open to candidates of any nationality. Each selected candidate will receive a Post-Doctoral fellowship from the São Paulo Research Foundation (FAPESP) in the amount of R$ 9,047.40 monthly and a research contingency fund, equivalent to 10% of the annual value of the fellowship which should be spent on items directly related to the research activity. 
     
    To apply, send email with CV and a recommendation letter to Professor Marin van Heel (marin.vanheel@lnnano.cnpem.br) and Professor Rodrigo Portugal (rodrigo.portugal@lnnano.cnpem.br) by February 4, 2024.

    Requirements to fill the position:

    - Having a degree in Physics, Computing, Engineering, Mathematics or related areas;
    - Meet all demands established by FAPESP in order to receive the fellowship;
    - Experience in managing HPC systems and Windows/Linux servers is desirable.