Bolsa de PD em Biofísica Molecular / Biologia Estrutural de Proteínas

Post-Doctoral Fellowship in Molecular Biophysics / Structural Biology

Nº: 6850

Área de conhecimento: Biofísica

Field of knowledge: Biophysics

Nº do processo FAPESP: 2021/10577-0

FAPESP process: 2021/10577-0

Título do projeto: Caracterização da estrutura e dinâmica do complexo central da membrana externa (OMCC) do T4SS de Xanthomonas citri usando simulações computacionais

Project title: Characterization of the structure and dynamics of the Xanthomonas citri T4SS outer membrane core complex (OMCC) using computer simulations

Área de atuação: Biofísica Molecular / Biologia Estrutural de Proteínas

Working area: Molecular Biophysics / Structural Biology

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador responsável: Shaker Chuck Farah

Principal investigator: Shaker Chuck Farah

Unidade/Instituição: Instituto de Química, Universidade de São Paulo (IQ-USP)

Unit/Instituition: Instituto de Química, Universidade de São Paulo (IQ-USP)

Data limite para inscrições: 15/04/2024

Deadline for submissions: 2024-04-15

Publicado em: 15/03/2024

Publishing date: 2024-03-15

Localização: Avenida Professor Lineu Prestes, 748, São Paulo

Locale: Avenida Professor Lineu Prestes, 748, São Paulo

E-mail para inscrições: cepid-b3@iq.usp.br

E-mail for proposal submission: cepid-b3@iq.usp.br

  • Resumo Summary

    Vaga de pós-doc disponível para trabalhar no Laboratório de Espectroscopia Biomolecular de Ressonância Magnética Nuclear (RMN) do Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão B³ (Biologia de Bactérias e Bacteriófagos), um CEPID apoiado pela FAPESP.

    Os Sistemas de Secreção do Tipo IV (T4SSs) são formados por subunidades altamente conservadas, estruturalmente dispostas em dois grandes subconjuntos: o complexo central da membrana externa (OMCC) e o complexo da membrana interna (IMC). O T4SS de Xanthomonas citri (T4SSXAC) é um sistema efetor especializado na secreção de toxinas que matam outras bactérias gram-negativas. O OMCC pode ser dividido em uma camada interna e uma externa. Surpreendentemente, observações prévias sugerem que elas podem apresentar movimentos independentes. Para esclarecer o mecanismo de ação do T4SS, investigaremos sua dinâmica. As regiões intrinsecamente desordenadas serão caracterizadas usando espectroscopia RMN em combinação com simulações computacionais.

    O candidato deve ser motivado, possuir doutorado em biologia estrutural ou áreas relacionadas e experiência em espectroscopia RMN de proteínas ou simulações MD. Não é necessário ter experiência prévia em clonagem molecular, expressão e purificação de proteínas, mas será um diferencial.

    As inscrições devem incluir: uma carta de motivação, descrevendo as razões de seu interesse na vaga; duas cartas de recomendação e um breve CV.

    A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 9.047,40 mensais e Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    A post-doctoral position is available to work in the Laboratory of Biomolecular Nuclear Magnetic Resonance (NMR) Spectroscopy within the Research, Innovation, and Dissemination Centre B³ (Biology of Bacteria and Bacteriophages), one of the Research, Innovation and Dissemination Centers (RIDCs) supported by the São Paulo Research Foundation (FAPESP) in São Paulo state, Brazil.

    Type IV Secretion Systems (T4SSs) are formed by a set conserved subunits, which are structurally arranged in two large subassemblies: the outer membrane core complex (OMCC) and the inner membrane complex (IMC). The T4SS of Xanthomonas citri (T4SSXAC) is an effector translocator system that is specialized in the secretion of toxins that kill other gram-negative bacteria. The OMCC may be divided in an inner layer (I-layer) and an outer layer (O-layer). Surprisingly, very few interactions between these two layers were observed, suggesting that they may display independent motions. To shed light on the T4SS functioning mechanism, we will investigate the dynamics of T4SS, intrinsically disordered regions will be characterized using NMR spectroscopy in combination with computer simulations.

    The successful candidate will be a motivated individual, holding a PhD in structural biology or related areas and experience in protein NMR spectroscopy or MD simulations. Prior experience in molecular cloning, protein expression and purification is not required but it will be a plus.

    Applications should include: A letter of motivation, two reference letters and a short CV.

    This opportunity is open to candidates of any nationality. The selected candidate will receive a FAPESP Post-Doctoral fellowship in the amount of R$ 9,047.40 monthly and a research contingency fund, equivalent to 10% of the annual value of the fellowship which should be spent on items directly related to the research activity.