Bolsa de TT-V em Bioinformática / Genômica

Level 5-Technical Training Fellowship in Bioinformatics / Genomics

Nº: 7165

Área de conhecimento: Genética

Field of knowledge: Genetics

Nº do processo FAPESP: 2022/11560-6

FAPESP process: 2022/11560-6

Título do projeto: EMU: Aquisição de equipamentos de genômica para sequenciamento de nova geração – Explorando DNA histórico em museus: um centro de museômica para expandir o valor das coleções biológicas e promover a descoberta da biodiversidade

Project title: EMU: acquisition of genomics equipment for next-generation sequencing – exploring historic DNA in museums: a museomics center to expand the value of biological collections and promote the discovery of biodiversity

Área de atuação: Bioinformática / Genômica

Working area: Bioinformatics / Genomics

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador responsável: Luís Fábio Silveira

Principal investigator: Luís Fábio Silveira

Unidade/Instituição: Museu de Zoologia, Universidade de São Paulo (MZ-USP)

Unit/Instituition: Museu de Zoologia, Universidade de São Paulo (MZ-USP)

Data limite para inscrições: 12/07/2024

Deadline for submissions: 2024-07-12

Publicado em: 25/06/2024

Publishing date: 2024-06-25

Localização: Avenida Nazaré, 481, São Paulo

Locale: Avenida Nazaré, 481, São Paulo

E-mail para inscrições: joyce.prado@usp.br

E-mail for proposal submission: joyce.prado@usp.br

  • Resumo

    Estamos à procura de um Bioinformata qualificado, com doutorado ou 5 anos de experiência na área, para se juntar à nossa equipe no Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo e liderar a configuração e gestão de um cluster de computação de alto desempenho (HPC) voltado para a pesquisa genômica da biodiversidade. O candidato ideal terá um forte conhecimento em biologia computacional, bioinformática e ampla experiência com sistemas HPC, incluindo configuração, gerenciamento e otimização de clusters. Ele trabalhará em estreita colaboração com os pesquisadores e funcionários para garantir o uso eficiente do cluster e ajudar a impulsionar nossa pesquisa em genômica.

    Principais Responsabilidades:

    • Projetar, configurar e gerenciar um cluster HPC baseado em Linux para análise de dados genômicos.

    • Implementar e manter a programação de tarefas e gerenciamento de recursos usando SLURM.

    • Otimizar o desempenho do sistema e garantir a utilização eficiente dos recursos.

    • Fornecer suporte ao usuário e treinamento para pesquisadores que utilizam o cluster HPC.

    • Desenvolver e manter a documentação para configuração do sistema e políticas de uso.

    • Colaborar com pesquisadores para otimizar e solucionar problemas em pipelines de bioinformática.

    • Monitorar a integridade do sistema, realizar manutenção regular e garantir a segurança e integridade dos dados.

    Mais informações sobre requisitos e benefícios da Bolsa FAPESP de Treinamento Técnico nível cinco (TT-V) estão em fapesp.br/3098 e fapesp.br/3162.

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