Bolsa de PD em Biologia Molecular / Sequenciamento Genético / Análise de Bioinformática / Coordenação de Equipe

Post-Doctoral Fellowship in Molecular Biology / Genetic Sequencing / Bioinformatics Analysis / Team Coordination

Nº: 7212

Área de conhecimento: Medicina

Field of knowledge: Medicine

Nº do processo FAPESP: 2023/09965-0

FAPESP process: 2023/09965-0

Título do projeto: SOMOS RAROS mas SOMOS MUITOS: Desenvolvimento de uma plataforma de referência para diagnóstico genético e orientação clínica via telemedicina de pacientes com Doenças Raras, em conformidade com as diretrizes do DECIT/SUS

Project title: Rare diseases are rare, but rare diseases patients are numerous: Development of a reference platform for genetic diagnosis and clinical counseling via telemedicine for patients with Rare Diseases, in accordance with DECIT/SUS guidelines

Área de atuação: Biologia Molecular / Sequenciamento Genético / Análise de Bioinformática / Coordenação de Equipe / Coordenação de Projeto

Working area: Molecular Biology / Genetic Sequencing / Bioinformatics Analysis / Team Coordination / Project Coordination

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Pesquisador responsável: Magda Maria Sales Carneiro Sampaio

Principal investigator: Magda Maria Sales Carneiro Sampaio

Unidade/Instituição: Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo (FM-USP)

Unit/Instituition: Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo (FM-USP)

Data limite para inscrições: 31/07/2024

Deadline for submissions: 2024-07-31

Publicado em: 10/07/2024

Publishing date: 2024-07-10

Localização: Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, 255 – Prédio dos Ambulatórios, Hospital das Clínicas (PAMB-HC), 2º andar, Bloco 08, São Paulo

Locale: Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, 255 – Prédio dos Ambulatórios, Hospital das Clínicas (PAMB-HC), 2º andar, Bloco 08, São Paulo

E-mail para inscrições: cigensequenciamento@gmail.com

E-mail for proposal submission: cigensequenciamento@gmail.com

  • Resumo Summary

    Atividades:

    - Gestão de dados clínicos e amostras, além da criação e gerenciamento de um banco central de dados com resultados de testes genéticos prévios de análise do genoma codificante (exoma);
    - Desenvolvimento de algoritmos para a identificação e seleção com casos inconclusivos;
    - Treinamento para interpretação dos dados do metiloma e genoma completo;
    - Análise dos dados genômicos, com aplicação de ferramentas de bioinformática ou do uso de plataformas de análises, segundo as recomendações vigentes;
    - Compilação dos resultados e discussão dos dados com equipe multidisciplinar;
    - Preparo de Relatórios Científicos;
    - Preparo e submissão de artigos científicos a periódicos relevantes à área.

    Requisitos:

    - Disponibilidade para desenvolvimento das atividades presencialmente de 2ª a 6ª feira, das 9h às 18h;
    - Experiência mínima de 3 anos como pós-doutor, atuando em projetos científicos e com vínculo institucional;
    - Experiência mínima de 3 anos com organização e manipulação de bancos de dados de projetos de pesquisa de grande porte (mais de 5);
    - Inglês fluente;
    - Experiência de pelo menos 4 anos em coordenação de projetos científicos;
    - Experiência de pelo menos 4 anos em coordenação de equipes e pessoas em projetos científicos;
    - Experiência de pelo menos 5 anos em diferentes técnicas de biologia molecular e sequenciamento genético por diferentes plataformas;
    - Experiência de pelo menos 4 anos em sequenciamento e análise de genoma;
    - Experiência e habilidade no treinamento e formação de equipes.

    A vaga está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 12.000,00 mensais (em vigor a partir de 01/08) e Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.

    Activities:

    - Management of clinical data and samples, as well as the creation and management of a central database with results from previous genetic tests of coding genome analysis (exome);
    - Development of algorithms for the identification and selection of inconclusive cases;
    - Training for the interpretation of methylome and whole genome data;
    - Analysis of genomic data, applying bioinformatics tools or analysis platforms according to current recommendations;
    - Compilation of results and discussion of data with a multidisciplinary team;
    - Preparation of scientific reports;
    - Preparation and submission of scientific articles to relevant journals in the field.

    Requirements:

    - Availability to perform activities in person from Monday to Friday from 9 AM to 6 PM;
    - Minimum of 3 years of post-doctoral experience, working on scientific projects with institutional affiliation;
    - Minimum of 3 years of experience in organizing and handling large-scale research project databases (more than 5);
    - Fluent English;
    - At least 4 years of experience in coordinating scientific projects;
    - At least 4 years of experience in coordinating teams and people in scientific projects;
    - At least 5 years of experience in various molecular biology techniques and genetic sequencing on different platforms;
    - At least 4 years of experience in genome sequencing and analysis;
    - Experience and teaching skills in training and forming teams.

    The fellow will be based at the University of São Paulo's Medical School (FM-USP) in Brazil.

    This opportunity is open to candidates of any nationality. The selected candidate will receive a Post-Doctoral fellowship from the São Paulo Research Foundation (FAPESP) in the amount of R$ 12,000.00 monthly (in force starting August 1st) and a research contingency fund, equivalent to 10% of the annual value of the fellowship which should be spent on items directly related to the research activity.