Bolsa de PD em Parasitologia Diagnóstica

Post-doctoral fellowship in Diagnostic Parasitology

Nº: 1490

Área de conhecimento: Biologia Geral

Field of knowledge: General biology

Nº do processo FAPESP: 2014/12236-1

FAPESP process: 2014/12236-1

Título do projeto: AnImaLS - Anotação de Imagem em Larga Escala: O que máquinas e especialistas podem aprender interagindo?

Project title: AnImaLS - Annotation of Images in Large Scale: What can machines and specialists learn from interaction?

Área de atuação: Parasitologia Diagnóstica

Working area: Diagnostic Parasitology

Pesquisador principal: Alexandre Xavier Falcão

Principal investigator: Alexandre Xavier Falcão

Unidade/Instituição: Institute of Computing / University of Campinas (UNICAMP)

Unit/Instituition: Institute of Computing / University of Campinas (UNICAMP)

Data limite para inscrições: 15/05/2017

Deadline for submissions: 2017-05-15

Publicado em: 17/03/2017

Publishing date: 2017-03-17

Localização: Av. Albert Einstein, 1.251 - Cidade Universitária, Campinas - SP, 13083-852

Locale: Av. Albert Einstein, 1.251 - Cidade Universitária, Campinas - SP, 13083-852

  • Resumo Summary

    Estamos buscando candidatos para uma bolsa de Pós-Doutorado de dois anos, para trabalhar na Faculdade de Medicina Veterinária (www.fmva.unesp.br) da Universidade Estadual de São Paulo (www.unesp.br/international) em Araçatuba, SP, em cooperação com o Laboratório de Ciência de Dados de Imagem (www.lids.ic.unicamp.br), Instituto de Computação (www.ic.unicamp.br/en), Universidade de Campinas - UNICAMP (www.unicamp.br/unicamp/english), Campinas, SP, Brasil.

    Esta bolsa faz parte de um Projeto Temático intitulado "AnImaLS - Anotação de Imagem em Larga Escala: O que máquinas e especialistas podem aprender interagindo?", que conta com colaboradores da Universidade de Campinas, Universidade de São Paulo (Brasil), Universidade da Pensilvânia (EUA), Universidade de West Virginia (EUA), Universidade de Groningen (Holanda) e Universidade de Jadavpur (Índia). Os objetivos do projeto são a compreensão e o aperfeiçoamento do processo de aprendizagem de máquina por meio da interação com especialistas, para a construção de sistemas explicáveis de tomada de decisão e de apoio à decisão com base na anotação de imagem. Dado que a bolsa é parte de um Projeto Temático financiado pela FAPESP, esta pode ser renovada por até 48 meses.

    Esta posição requer pesquisa, desenvolvimento e validação de técnicas parasitológicas que sejam adequadas para o diagnóstico automatizado de parasitas gastrintestinais em bovinos. Nosso sistema de diagnóstico baseia-se na aquisição e análise automatizadas de imagens, mas requer lâminas de microscopia ricas em parasitos e o mais livre possível de impurezas fecais. Isso impõe um desafio ao desenvolvimento de novas técnicas parasitológicas. O aluno irá trabalhar em colaboração com alunos de pós-graduação da Ciência da Computação, cujos trabalhos envolvem processamento e análise de imagem de parasitos.

    É desejável que o candidato demonstre domínio de conhecimento em Parasitologia Diagnóstica.

    A bolsa de Pós-Doutorado inclui uma mensalidade de R$ 6.819,30, acesso ao sistema de saúde da UNESP e fundos de contingência para pesquisa de 15% do valor anual da bolsa. Verifique os detalhes em fapesp.br/en/5427.

    Os candidatos interessados devem enviar um e-mail com carta de motivação para a aplicação; carta de recomendação de um supervisor anterior; curriculum vitae com lista de publicações, educação e experiência; e cópia do(s) diploma(s), para Alexandre Xavier Falcão (afalcao@ic.unicamp.br).

    A seleção de candidatos será feita via IC-UNICAMP.
    Prazo para inscrições: 15 de maio de 2017.

    We are seeking candidates for a two-year post-doctoral fellowship to work at the Faculty of Veterinary Medicine (www.fmva.unesp.br), State University of São Paulo (www.unesp.br/international), in Araçatuba, SP, Brazil, in cooperation with the Laboratory of Image Data Science (www.lids.ic.unicamp.br), Institute of Computing (www.ic.unicamp.br/en), University of Campinas - UNICAMP (www.unicamp.br/unicamp/english), Campinas, SP, Brazil.

    This fellowship is part of a Thematic Project entitled "AnImaLS - Annotation of Images in Large Scale: what can machines and specialists learn from interaction?", with collaborators from the University of Campinas (Brazil), University of São Paulo (Brazil), State University of São Paulo (Brazil), University of Pennsylvania (EUA), West Virginia University (EUA), University of Groningen (Netherlands), and Jadavpur University (India). The goals of the project are the understanding and improvement of the machine learning process through human interaction, for the construction of explainable decision making and decision support systems based on image annotation. Given that the fellowship is part of a Thematic Project funded by FAPESP, it can be renewed up to 48 months.

    This fellow position requires research, development, and validation of parasitological techniques that are suitable to the automated diagnosis of gastrintestinal parasites in bovines. Our diagnosis system is based on automated image acquisition and analysis, but it requires microscopy slides rich in parasites and as free as possible of fecal impurities. This imposes a challenge to the development of new parasitological techniques. The fellow will work in collaboration with graduate students in Computer Science, whose works involve image processing and analysis of parasites.

    It is desirable that the candidate demonstrates knowledge domain in Diagnostic Parasitology.

    The post-doctoral fellowship includes a monthly stipend of R$ 6.819,30 (about US$ 2,150 and EU$ 2,000), access to the health-care system of UNESP, and research contingency funds of 15% of the annual value of the fellowship. Please verify the details at www.fapesp.br/en/5427.

    Interested candidates should email motivation letter for the application, recommendation letter from a previous supervisor, curriculum vitae with list of publications, education and experience, and copy of diplomas/degree certificate(s) to Alexandre Xavier Falcão (afalcao@ic.unicamp.br).

    The deadline for applications is May 15th, 2017.