Bolsa de TT-IV-A em Bioinformática

Level 4A-Technical Training Fellowship in Bioinformatics

Nº: 3207

Área de conhecimento: Ciência da Computação

Field of knowledge: Computer science

Nº do processo FAPESP: 2018/00031-7

FAPESP process: 2018/00031-7

Título do projeto: Estudos sobre comparação de genomas

Project title: Studies on genome comparison

Área de atuação: Bioinformática

Working area: Bioinformatics

Quantidade de vagas: 1

Number of places: 1

Início: 01/02/2019

Start: 2019-02-01

Pesquisador principal: João Meidanis

Principal investigator: João Meidanis

Unidade/Instituição: Instituto de Computação / Unicamp

Unit/Instituition: Instituto de Computação / Unicamp

Data limite para inscrições: 31/12/2019

Deadline for submissions: 2019-12-31

Publicado em: 27/09/2019

Publishing date: 2019-09-27

Localização: Av Albet Einstein, 1251, Campinas

Locale: Av Albet Einstein, 1251, Campinas

E-mail para inscrições: meidanis@scylla.com.br

E-mail for proposal submission: meidanis@scylla.com.br

  • Resumo

    Este projeto busca avançar a teoria matricial de rearranjo de genomas, aplicando-a à construção de filogenias usando rearranjos e a inferência dos genomas ancestrais nos nós internos. E também a refinar os métodos, aperfeiçoando os algoritmos que os implementam.

    Descrição das vagas:

    A pessoa contemplada deverá se familiarizar com os programas já desenvolvidos por nosso grupo e auxiliar-nos a criar um repositório para compartilhá-los. Deverá também verter os programas escritos em Matlab ou Octave para Python e R.

    Atividades:

    - Estudo da teoria matricial de rearranjos (4 meses);
    - Organização de repositório GitHub ou equivalente, permissões, política de atualização, etc. (1 mês);
    - Tradução de programas de Matlab/Octave para Python e R (3 meses);
    - Disponibilização dos programas no repositório (1 mês).

    Benefícios e Requisitos:

    A pessoa selecionada receberá uma bolsa de Treinamento Técnico Nível TT4A fornecida pela FAPESP, para dedicação em tempo integral, com valor mensal de R$ 5.087,20 e duração de 09 meses.

    Os candidatos ideais deverão possuir desenvoltura em Python, Matlab, R e Octave. Além disso, deverão ter familiaridade com ferramentas de bioinformática e proficiência em álgebra linear.

    Demais requisitos e benefícios estão disponíveis no site www.fapesp.br/bolsas/tt.